Biomics

The interaction between ammonia and carboxylate groups in amino acids such as H₃N⁺(CH₂)_nCOO^- (n = 1 - 4), H₃N⁺CH(X) COO^- (X = H-, СH₃-, (CH₃)₂CH-, CH₃(HO)CH-, HOCH₂-, HSCH₂-, HOOCCH₂-, ^-OOCCH₂-, HOOCCH₂CH₂-, ^-OOCCH₂CH₂-) and peptides (containing Lys-Glu) was investigated by computational modeling method.

amino acids, peptides, electrostatic interaction, hydrogen bond, computational modeling

1. Якубке Х.Д., Ешкайт Х. Аминокислоты, пептиды, белки. – М.: Мир. 1985. 456 с.
2. Клюев С.А. Конформеры карнозина // Биофизика. 2006. Т. 51. № 4. С. 669-672.
3. Клюев С.А. Информационные технологии в биохимическом образовании // Современные информационные технологии и ИТ-образование. V-я международная НПК. Сборник материалов. Москва. 2010. http://2010.it-edu.ru/pages.
4. Москва В.В. Водородная связь в органической химии // Соросовский образовательный журнал. 1999. №2. C. 58-64.
5. Водородная связь / Под ред. Н.Д. Соколова. – М.: Наука, 1981. 399с.
6. Theoretical treatment of hydrogen bonding / Ed. by D. Hadzi. Chichester: Wiley. 1997. 510 p.
7. Кларк Т. Компьютерная химия. – М.: Мир. 1990. 383 c.
8. Вода: структура, состояние, сольватация. Достижения последних лет / Отв. ред. А.М. Кутепов. – М.: Наука. 2003. 404 с.
9. Вranden C., Tooze J. Introduction to protein structure. Garland Publ. 1991. 302 p.
10. Schuler B., Eaton W.A. Protein folding studied by single-molecule FRET // Curr. Opin. Struct. Biol. 2008. V. 18. P. 16-26.
11. Berman H. M. The Protein Data Bank: a historical perspective // Acta Crystallographica Section A: Foundations of Crystallography. 2008. A64 (1). P. 88-