Компьютерное моделирование взаимодействия между заряженными группами в аминокислотах и пептидах
Год: 2012
Страницы: 99-104
Номер: Том 2, № 2
Тип: научная статья
Аннотация:
Исследовано взаимодействие между аммонийной и карбоксилатной группами в аминокислотах типа H3N + (CH2)nCOO- (n = 1 - 4), H3N +CH(X) COO- (X = H-, СH3-, (CH3)2CH-, CH3(HO)CH-, HOCH2-, HSCH2-, HOOCCH2-, -OOCCH2-, HOOCCH2CH2-, -OOCCH2CH2-) и пептидах (содержащих Lys-Glu) методом компьютерного моделирования.
Ключевые слова:
аминокислоты, пептиды, электростатическое взаимодействие, водородная связь, компьютерное моделирование
Библиографический список:
- Якубке Х.Д., Ешкайт Х. Аминокислоты, пептиды, белки. – М.: Мир. 1985. 456 с.
- Клюев С.А. Конформеры карнозина // Биофизика. 2006. Т. 51. № 4. С. 669-672.
- Клюев С.А. Информационные технологии в биохимическом образовании // Современные информационные технологии и ИТ-образование. V-я международная НПК. Сборник материалов. Москва. 2010. http://2010.it-edu.ru/pages.
- Москва В.В. Водородная связь в органической химии // Соросовский образовательный журнал. 1999. №2. C. 58-64.
- Водородная связь / Под ред. Н.Д. Соколова. – М.: Наука, 1981. 399с.
- Theoretical treatment of hydrogen bonding / Ed. by D. Hadzi. Chichester: Wiley. 1997. 510 p.
- Кларк Т. Компьютерная химия. – М.: Мир. 1990. 383 c.
- Вода: структура, состояние, сольватация. Достижения последних лет / Отв. ред. А.М. Кутепов. – М.: Наука. 2003. 404 с.
- Вranden C., Tooze J. Introduction to protein structure. Garland Publ. 1991. 302 p.
- Schuler B., Eaton W.A. Protein folding studied by single-molecule FRET // Curr. Opin. Struct. Biol. 2008. V. 18. P. 16-26.
- Berman H. M. The Protein Data Bank: a historical perspective // Acta Crystallographica Section A: Foundations of Crystallography. 2008. A64 (1). P. 88-95