Анализ in silico экспрессии генов β-1,3-глюканаз флоэмных волокон льна Linum usitatissimum L. при гравиответе

21.08.2024
Авторы:
Ибрагимова Н.Н.
Название:
Анализ in silico экспрессии генов β-1,3-глюканаз флоэмных волокон льна Linum usitatissimum L. при гравиответе
Страницы:
202-213
скачано
5 раз(а)


У льна Linum usitatissimum L. in silico идентифицированы ортологи β-1,3-глюканаз (BG) Arabidopsis thaliana L. Им соответствовали 57 последовательностей, сгруппированные в 27 ортологичных групп. Для 22 основных ортологов, проявляющих изменение экспрессии на уровне генов во время развития волокна (индивидуальной клетки) в норме (разные стадии), предсказаны белковые домены, характерные для β-1,3-глюканаз и проведен анализ временных (8 ч, 24 ч, 96 ч после наклона стебля) и пространственных (верхняя (PUL) и нижняя (OPP) стороны стебля растения) профилей экспрессии при гравиответе. Большинство анализируемых BG проявляли максимум экспрессии в апикальной меристеме. В ответ на гравистимуляцию изменение экспрессии выявлено у генов 11 BG. Из них 7 генов проявляли повышение экспрессии в волокнах обеих сторон стебля (Lus10015151, Lus10040461, Lus10033244), PUL-стороны (Lus10019801, Lus10039095 и Lus10032562) и OPP-стороны (Lus10024535). Понижение экспрессии при гравиответе выявилось у генов Lus10011482, Lus10002295, Lus10043075 и Lus10038099. При этом для Lus10011482 и Lus10043075 активность была обнаружена на обеих сторонах стебля через 8, 24 и 96ч после наклона растений. При гравиответе значение экспрессии генов основных ортологов изменялось в сторону более молодой стадии развития волокна и часто подтверждалось изменением экспрессии всех генов соответствующей ортологичной группы. Предполагается локализация соответствующих β-1,3-глюканаз в клеточной стенке и ее модификация для проявления «мускульных» функций волокон. Данное исследование обеспечивает основу для выяснения функциональных характеристик β-1,3-глюканаз в процессе развития волокна и при гравиответе.
Заказ
Оформите заказ, наш сотрудник свяжется с вами для уточнения деталей.
Ваша заявка успешно отправлена!
Необходимо принять условия соглашения
Вы заполнили не все обязательные поля
Произошла ошибка, попробуйте ещё раз

Обратный звонок
Представьтесь, мы вам перезвоним.
Ваша заявка успешно отправлена!
Необходимо принять условия соглашения
Вы заполнили не все обязательные поля
Произошла ошибка, попробуйте ещё раз