Метилирование ДНК у комнатной мухи Musca domestica L.
Год: 2016
Страницы: 266-274
Номер: Том 8, № 3
Тип: научная статья
Рубрика: Статьи
Авторы: Никоноров Юрий Михайлович, Ахметкиреева Тансулпан Тимерхановна, Беньковская Галина Васильевна
Аннотация:
Метилирование ДНК играет существенную роль в регуляции генной активности у животных и растений. Однако у представителей ряда таксонов насекомых (Diptera, в том числе) системы метилирования ДНК в той или иной мере редуцированы, и они могут представлять интерес в качестве модельных объектов для исследования явления фенотипической пластичности, реализуемой через различные эпигенетические механизмы. С помощью метода метилчувствительной ПЦР мы провели определение наличия 5-метилцитозина в ДНК комнатной мухи на стадии личинки III возраста, пупария (куколки) и 2-х и 3-х недельных имаго. Размах индивидуальных различий между особями по относительной устойчивости ДНК к расщеплению рестрикционной эндонуклеазой HpaII по некоторым локусам составил от 0.01 до 4.21%.
Ключевые слова:
метилирование ДНК, комнатная муха, Musca domestica, 5-метилцитозин
Библиографический список:
- Беньковская Г.В. Возможности и ограничения изменений продолжительности жизни в лабораторном эксперименте // Успехи геронтол. 2010. Т.23. № 3. С.442-446.
- Гончар Д.А., Акишев А.Г., Дегтярев С.Х. BlsI- и GlaI- ПЦР анализ - новый метод исследования метилированных участков ДНК // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии. 2010. Т.6. №1. С.5-12.
- Angers B., Castonguay E., Massicotte R. Environmentally induced phenotypes and DNA methylation: how to deal with unpredictable conditions until the next generation and after // Mol. Ecol. 2010. V.19. P.1283-1295.
- Barchuk A.R., Cristino A.S., Kucharski R. et al. Molecular determinants of caste differentiation in the highly eusocial honeybee Apis mellifera // BMC Dev. Biol. 2007. V.7. P.70-88.
- Eissenberg J.C., Shilafiard A. Histone H3 lysine 4 (H3K4) methylation in development and differentiation // Dev. Biol. 2010. V.339. N2. P.240-249.
- Elango N., Hunt B.G., Goodisman M.A.D., Yi S.V. DNA methylation is widespread and associated with differential gene expression in castes of the honeybee, Apis mellifera // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V.106: P.11206-11.
- Fulnecek J., Kovarik A. How to interpreted Methylation Sensitive Amplified Polymorphism (MSAP) profiles? //BMC Genetics.2014. V.15. N2. P.1-9.
- Glastad K.M., Hunt B.G., Yi S.V., Goodisman M.A.D. DNA methylation in insects: on the brink of the epigenomic era // Insect. Mol. Biol. 2011. Vol.13. P.117-123.
- Greenberg B. Flies and disease // Sci. Am. 1965. V.213. P.92-99.
- Hough-Evans B., Jacobs-Lorena M., Cummings M.R., Roy J. Complexity of RNA in eggs of Drosophila melanogaster and Musca domestica // Genetics. 1980. V.95. P.81-94.
- Hung M.S., Karthikeyan N., Huang B. et al. Drosophila proteins related to vertebrate DNA (5-cytosine) methyltransferases // Proc. Natl. Acad. Sci USA. 1999. 96(21), p. 11940-11945.
- Jablonka E., Lamb M.J. Epigenetic inheritance in evolution // J. Evol. Biol. 1998. V.11. P.159-183.
- Koryakov D.E., Walther M., Ebert A., et al. The SUUR protein is involved in binding of SU(VAR)3-9 and methylation of H3K9 and H3K27 in chromosomes of Drosophila melanogaster // Chromosome Res. 2011 V.19. N2. P.235-249.
- Law R., Ferro A.J., Cummings M.R., Shapiro S.K. tRNA methyltransferases during embryogenesis in Musca domestica // Developmental Biology. 1976. V.54. N.2. P.304-307.
- Lim U., Song M.A. Dietary and lifestyle factors of DNA methylation // Methods Mol. Biol. 2012. V.863. P.359-376.
- Lyko F., Ramsahoye B.H., Jaenisch R. Development DNA methylation in Drosophila melanogaster // Nature. 2000. V.408. Р.538-540.
- Maleszka R. Epigenetic integration of environmental and genomic signals in honey bees: The critical interplay of nutritional, brain and reproductive networks // Epigenetics. 2008. V.3. P.188-192.
- Mandrioli M., Borsatti F. DNA methylation of fly genes and transposons // Cell. Mol. Life Sci. 2006. V.63. P.1933-1936.
- Mazin A.L. Suicidal function of DNA methylation in age-related genome disintegration // Ageing Research Reviews. 2009. V.8. P.314-327.
- Morgan H.D., Santos F., Green K., Dean W., Reik W. Epigenetic reprogramming in mammals // Human Molecular Genetics. 2005. V.14. P.47-58.
- Raddatz G., Guzzardo P.M., Olova N., Fantappie M.R. et al. Dnmt2-dependent methylomes lack defined DNA methylation patterns // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013. V.110. N.21. P.8627-8631.
- Rae P.M.M., Steele R.E. Absence of cytosine methylation at C-C-G-G and G-C-G-C sites in the rDNA coding regions and intervening sequences of Drosophila and the rDNA of other higher insects // Nucleic Acids Res. 1979. V.6. N.9. P.2987-2995.
- Salzberg A., Fisher O., Siman-Tov R., Ankri S. Identification of methylated sequences in genomic DNA of adult Drosophila melanogaster // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004. V.322. P. 465-469.
- Scott J.G., Warren W.C., Beukeboom L.W., Boop D. et al. Genome of the house fly, Musca domestica L., a global vector of diseases with adaptations to a septic environment // Genome Biology. 2014. V.15. P. 466-481.
- Singer-Sam J., Grant M., LeBon J.M. et al. Use of a HpaII-Polymerase Chain Reaction Assay to study DNA methylation in the Pgk-1 CpG island of Mouse Embryos at the Time of X-Chromosome Inactivation // Mol. Cell Biol. 1990. V.10. P.4987-4989.
- Solis M.T., Rodriguez-Serrano M., Meijon M. et al. DNA methylation dynamics and MET1a-like gene expression changes during stress-induced pollen reprogramming to embryogenesis // J. Exp. Bot. 2012. V.63. N.18. P.6431-6444.
- Takayama S., Dhahbi J., Roberts A. et al. Genome methylation in D. melanogaster is found at specific short motifs and is independent of DNMT2 activity // Genome Res. 2014. V.24. N.5. P.821-830.
- Tweedie S., Ng H.H., Barlow A.L. et al. Vestiges of a DNA methylation system in Drosophila melanogaster? // Nat. Genet. 1999. V.23. P.389-390.
- Zemach A., McDaniel I.E., Silva P., Zilberman D. Genome-wide evolutionary analysis of eukaryotic DNA methylation // Science. 2010. V.328. N.5980. P.916-919.
- Zhang G., Huang H., Liu D. et al. N6methyladenine DNA modification in Drosophila // Cell. 2015. V.161. P.893-906. doi:10.1016/j.cell.2015.04.018.