Метагеномный алгоритм создания диагностикумов для выявления РНК-содержащих вирусов пчел
Год: 2016
Страницы: 36-39
Номер: Том 8, № 1
Тип: научная статья
Рубрика: Статьи
Авторы: Калашников А.Е, Бурмистрова Л.А, Бородачев В.И, Масленникова В.И., Королев А.В., Гладырь Е.А
Аннотация:
Применение биоинформационных технологий и технологий анализа необходимо для создания диагностикумов нового поколения. Создание таких тестов требует как нового подхода к расчетам селективной части, так и подбору реагентов. Представленный пример позволяет пойти более эффективным путем при выявлении ретровирусов и анализа их геномов. Применение диагностикума на практике выявило высокую степень инфицированности племенных и частных пасек в Рязанской области.
Ключевые слова:
ретровирусы, метагеномика, вариабельность вирусов, Apis mellifera, кинетика мутаций, диагностика
Библиографический список:
- Зиновьева Н.А., Костюнина О.В., Гладырь Е.А., Банникова А.Д., Харзинова В.Р., Ларионова П.В., Шавырина К.М., Эрнст Л.К. Роль ДНК-маркеров признаков продуктивности сельскохозяйственных животных // Зоотехния. 2010. №1. C. 8-10.
- Калашников А.Е., Удина И.Г. Эпидемиологическое состояние некоторых пасек при инфицировании семей пчел РНК-содержащими вирусами // VetPharma. Pharm Animals, 2014(1). C. 80-84.
- Удина И.Г., Кунижева С.С., Гришечкин А.Е., Калашников А.Е., Учаева В.С., Кривцов Н.И., Злобин В.И Обнаружение вируса деформации крыла у медоносной пчелы Apis mellifera L. на пасеках в Московской области методом ОТ-ПЦР // Вопросы вирусологии, 2010(5). C. 37-40.
- Berenyi O., Bakonyi N., Derakhshifar I., Koglberger H., Nowotny N. Occurrence of six honeybee viruses in diseased Austrian apiaries // Appl Envir Microbiology. 2006. V.72. N.4. P. 2414-2420.
- Chen Y.P., HigginsJ. A., Feldlaufer M.F. Quantitative Real-Time Reverse Transcription- PCR Analysis of Deformed Wing Virus Infection in the Honeybee (Apis mellifera L.) // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V.71. N.1. P. 436-441.
- DeMiranda J.R., Genersch E. Deformed wing virus // J Intertebr Patology. 2010. V.103. N.1. P. 48-61.
- Livak K.J., Schmittgen T.D., Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR data // Methods. 2001. V.25. P. 402-408.
- Mackay I.M., Real-time PCR in the microbiology laboratory // Clinical Microbiology and Infection. 2002. V.10. I.3. P.190-212.