Biomics

Nodule bacteria (rhizobia) is a genetically heterogeneous group of soil gram-negative microorganisms, able to enter into nitrogen-fixing symbiosis with legume plants. These microorganisms are characterized by a high plasticity of the genome associated largely with horizontal gene transfer, mostly by conjugation. In this paper, the proposed method of detection of conjugative interaction between strains of nodule bacteria based on their transformation of engineered structures on the basis of mobilized plasmids carrying marker genes are fluorescent proteins.

conjugation, nodule bacteria, rhizobia, fluorescent proteins, horizontal gene transfer

Баймиев Ан.Х., Гуменко Р.С., Матниязов Р.Т., Чубукова О.В., Баймиев Ал.Х. Современная систематика клубеньковых бактерий // Биомика. 2013. Т.5. С.136-157.

Баймиев Ан. Х., Ямиданов Р.С., Матниязов Р.Т., Благова Д.К., Баймиев Ал.Х., Чемерис А.В. Получение флуоресцентно меченых штаммов клубеньковых бактерий дикорастущих бобовых для их детекции in vivo и in vitro // Молекулярная биология. 2011. Т. 45. С.984-991.

Борисов А.Ю., Васильчиков А.Г., Ворошилова В.А., Данилова Т.Н., Жернаков А.И., Жуков В.А., Королева Т.А., Кузнецова Е.В., Мадсен Л., Мофетт М., Наумкина Т.С., Неманкин Т.А., Овчинникова Е.С., Павлова З.Б., Петрова Н.Э., Пинаев А.Г., Радутоиу С., Розов С.М., Рычагова Т.С., Соловов И.И., Стоугаард И., Топунов А.Ф., Уиден Н.Ф., Цыганов В.Е., Штарк О.Ю., Тихонович И.А. Регуляторные гены гороха посевного (Pisum sativum L.), контролирующие развитие азотфиксирующих клубеньков и арбускулярной микоризы: фундаментальные и прикладные аспекты // Прикладная биохимия и микробиология. 2007. Т. 43. С. 265–271.

Воробьева Л. И. Промышленная микробиология / Л. И. Воробьева. М.: Высш. шк., 1989. 294 С.

Дебабов В. Г. Современные методы создания промышленных штаммов микроорганизмов / В. Г. Дебабов, В. А. Лившиц. М.: Высш. шк., 1988. 211 С.

Онищук О.П., Симаров Б.В. Генетическая изменчивость нодуляционной конкурентоспособности у клубеньковых бактерий и ее использование в селекции // Генетика. 1995. Т. 31. С. 293 – 303.

Проворов Н.А., Воробьев Н.И. Эволюционная генетика клубеньковых бактерий: молекулярные и популяционные аспекты // Генетика. 2000. Т. 36. С. 1573-1587.

Симаров Б.В., Аронштам А.А., Новикова Н.И., Проворов, Н.А., Симаров Б.В., Шарыпова Л.А. Генетические основы селекции клубеньковых бактерий / Л.: Агропромиздат, 1990. - 192 с.

Brom S., de los Santos A.G., de Lourdes Girard M., Davilla G., Palacios R., Romero D. Highfrequency rearrangements in Rhizobium leguminosarum bv. phaseoli plasmids // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 1344–1346.

Guo X., Flores M., Mavingui P., Fuentes S.I., Hernandez G., Davila G., Palacios R. Natural genomics design in Sinorhizobium meliloti: novel genomic architectures. // Genome Res. 2003. V. 8. P. 1810–1817

Herrera-Carvera J.A., Sanjuan-Panilla J.M., Oliveres J., Sanjuan J. Cloning and identification of conjugative transfer origins in Rhizobia meliloti genome // J. Bacterol. 1998. V.180. P.4583-4590.

Henderson D. and Meyer R. The MobA-linked primase is the only replication protein of R1162 required for conjugal mobilization // J. Bacteriol. 1999. V. 181, 2973-2978.

Krol J., Mazur A., Marczak M., Skorupska A. Syntenic arrangements of the surface polysaccharide biosynthesis genes in Rhizobium leguminosarum // Genomics. 2007. V. 89. P. 237–247.

Jumas-Bilak E., Michaux-Charachon S., Bourg G., Ramuz M., Allardet-Servent A. Unconventional genomic organization in the alpha subgroup of the Proteobacteria. // J Bacteriol. 1998. V. 180. P. 2749–2755.

Lin J-J. Electrotransformation of Agrobacterium / In: Methods in molecular biology. Ed. Nickoloff J.A. Totowa: Humana Press, 1995. pp. 171–178.

Meijer W.J., Wisman G.B., Terpstra P., Thorsted P.B., Thomas СМ., Holsappel S., Venema G., Bron S. Rolling-circle plasmids from Bacillus subtilis: complete nucleotide sequences and analyses of genes of pTA1015, pTA1040, pTA1050, and comparisons with related plasmids from gram-positive bacteria // FEMS Microbiol. Rev. 2000. V. 21. P. 337-368.

Parniske M.. Arbuscular mycorrhiza: the mother of plant root endosymbioses // Nat. Rev. Microbiol. 2008. V. 6. P. 763–775.

Pansegrau W., Lanka E. Common sequence motifs in DNA relaxases and nick regions from a variety of DNA transfer systems // Nucleic Acids Res. 1991. V. 19. P. 3455.

Perwez T., Meyer R.J. Mobilization of the non-conjugative plasmid RSFIOIO: a genetic and DNA sequence analysis of the mobilization region // Mol. Gen. Genet. 1999. V. 206. P. 161-168.

Pretorius-Guth I.M., Puhler A., Simon R. Conjugal transfer of megaplasmid 2 between Rhizobium meliloti streins in alfalfa nodules // Appl. Environ. Microbiol. 1990. V. 56. P. 2354-2359.

Scherzinger E., Lurz R., Otto S., Dobrinski B. In vitro cleavage of double- and single-stranded DNA by plasmid RSF1010-encoded mobilization proteins // Nucleic Acids Res. 1992. Vol. 20. P.418.

Simon R., Priefer U., Puhler A. A broad host range mobilization system for in vivo genetic engineering: transposon mutagenesis in gram-negative bacteria // Biotechnology. 1983. V.1. P.784-791.

Zhang S., Meyer R.J. Localized denaturation of oriT DNA within relaxosomes of the broad-host-range plasmid R1162 // Mol. Microbiol. 1995. V. 17. P. 727-735.

Zhang S., Meyer R. The relaxosome protein MobC promotes conjugal plasmid mobilization by extending DNA strand separation to the nick site at the origin of transfer // Mol. Microbiol. 1997. V. 25. P. 509-516.