Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris L.). VI. Геномное in silico штрих-кодирование собачьих геномов и геномов их диких сородичей

Для выявления полиморфизма ДНК у собак и их диких сородичей применен довольно простой способ в виде виртуальной амплификации неких случайных участков генома с помощью мультиплексного RAPD-анализа с праймерами с произвольными нуклеотидными последовательностями, не требующий предварительного знания последовательностей азотистых оснований детектируемых фрагментов ДНК. При этом информация о полных геномах исследуемых видов прогнозировать ожидаемые результаты, что дает возможность до проведения «мокрых» экспериментов произвести отбраковку неподходящих праймеров. Проведенный in silico мультиплексный RAPD-анализ с 12 декамерными праймерами, последовательности которых исключают образование в ПЦР гомо- и гетеродимеров показал как геномное сходство, так и отличия между разными видами псовых. Если удалять из конечных результатов такой виртуальной амплификации общие для всех исследуемых образцов собак ампликоны, оставляя только значимые, выступающие фактически индивидуализирующими, то потенциально можно ДНК-паспортизировать каждую особь с вероятностью случайного совпадения их геномных штрихкодов в среднем одно событие на квадриллион.