eISSN: 2221-6197 DOI: 10.31301/2221-6197

Biomics

Архив номеров

Индексирование
  1. Главная
  2. →
  3. 2021
  4. →
  5. Том 13, № 3
  6. →
  7. Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris L.). III. VNTR- и STR-локусы. Их применение в собаководстве и криминалистике

Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris L.). III. VNTR- и STR-локусы. Их применение в собаководстве и криминалистике

Год: 2021

Страницы: 321-346

Номер: Том 13, № 3

Тип: научная статья

DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-23

Рубрика: Статьи

Авторы: Гарафутдинов Равиль Ринатович, Геращенков Григорий Алексеевич, Чемерис Алексей Викторович, Чемерис Дмитрий Алексеевич, Гиниятов Айрат Ришатович, Сахабутдинова Ассоль Рафиковна, Алексеев Яков Игоревич, Аминев Фарит Гизарович

Скачать pdf

Аннотация:

Рассмотрено применение в собаководстве и в криминалистике мини- и микросателлитных полиморфизмов ДНК собак, обозначаемых также как VNTR- и STR-локусы соответственно. Показано их применение в собаководстве для выяснения родословных, установления отцовства и чистопородности, а также для дифференциации пород преимущественно в виде микросателлитного полиморфизма ДНК. В криминалистике собаки могут быть как участниками преступлений в виде нападений на человека или домашних животных, так и некими свидетелями через ДНК которых, экстрагированную из их шерсти или фекалий, путем ДНК-идентификации конкретной собаки можно «выйти» на преступника или хотя бы на место совершения преступления, что также является хорошим подспорьем в его раскрытии. При этом популяционные исследования собак, в ходе которых устанавливается распространенность на разных территориях тех или иных аллелей маркерных признаков в виде STR-локусов, способствуют принятию правильных решений. Описаны базы данных по STR-полиморфизму ДНК собак или их прообразы. Уделено внимание источникам криминалистической собачьей ДНК, а также методам ее экстракции и предварительной оценке выделенных препаратов. Использование VNTR-полиморфизма носило довольно непродолжительный характер, и было довольно быстро заменено STR-полиморфизмом. Отмечены некоторые тенденции внедрения в эту область новых полиморфных признаков в виде однонуклеотидных замен или снипов (SNP), потенциально дающих более точную информацию, в том числе для ДНК-идентификации отдельных особей. Обсуждаются вопросы поголовной ДНК- паспортизации собак, которая может способствовать повышению культуры содержания собак и позволит в будущем ликвидировать бездомных собак, что будет носить как гуманный характер, так и потенциально уменьшит число собак-агрессоров.

Ключевые слова:

собаки, собачий, Canis familiaris, полиморфизм ДНК, минисателлиты, микросателлиты, VNTR-локусы, STR-локусы, собаководство, криминалистика

Библиографический список:

  1. Анисимов В.А., Гарафутдинов Р.Р., Сагитов А.М., Сахабутдинова А.Р., Хуснутдинова Э.К., Аминев Ф.Г., Чемерис А.В. ДНК-криминалистика – зарождение, современность и перспективы // Биомика. 2019.  Т.11(3).  С.  282-314.  DOI:  https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2019-26  
  2. Гарафутдинов    Р.Р.,    Гайнуллина    К.П., Кирьянова  О.Ю.,  Юрина  А.В.,  Долматова  И.Ю., Логинов О.Н., Чемерис А.В. Полиморфизм ДНК лошади Equus caballus и методы его выявления // Биомика. 2020. Т.12(2). С. 272-299. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2020-16 
  3. Гарафутдинов Р.Р., Сахабутдинова А.Р., Алексеев Я.И., Чемерис А.В. Гендерные локусы в ДНК- криминалистике и женском спорте // Biomics. 2021. Т.13(1). С.54-74. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-6  
  4. Гиниятов Ю.Р., Чемерис Д.А., Яхин О.И., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В. Прасобаки, собаки и их будущее // Biomics. 2021. Т.13(3). С. 288-297. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-20  
  5. Кирьянова О.Ю., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис Д.А., Гиниятов Ю.Р., Губайдуллин И.М., Чемерис А.В. Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris L.). II. RAPD-анализ // Biomics. 2021. Т.13(3). С. 309-320. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-22 
  6. Сахабутдинова А.Р., Чемерис Д.А., Гарафутдинов Р.Р., Алексеев Я.И., Гиниятов Ю.Р., Аминев Ф.Г., Чемерис А.В. Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris) и его применение. IV. мтДНК // Biomics. 2021. Т.13(3). С.347-359. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-24
  7. Чемерис А.В., Аминев Ф.Г., Гарафутдинов Р.Р., Анисимов В.А., Сагитов А.М., Хуснутдинова Э.К., Сахабутдинова А.Р., Чемерис Д.А., Михайленко К.И. ДНК-криминалистика. М., Наука. 2022. 25 авт.л. 8.    Чемерис А.В., Чемерис Д.А., Магданов Э.Г., Гарафутдинов Р.Р., Нагаев Н.Р., Вахитов В.А. Причины ложно-негативной ПЦР и недопущение некоторых из них // Биомика. 2012. Т. 4. № 1. С. 31-47.
  8. Чемерис Д.А., Гарафутдинов Р.Р., Сагитов А.М., Сагитова М.А., Михайленко К.И., Зубов В.В., Василов Р.Г., Сломинский П.А., Анисимов В.А., Хуснутдинова Э.К., Алексеев Я.И., Курочкин В.Е., Лавров Г.С., Воробьѐв А.А., Аминев Ф.Г., Чемерис А.В. Микродиплотипы как новые маркеры для ДНК- идентификации личности // Биомика. 2020. Т.12(2). С. 300-317. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2020-17 
  9. Чемерис Д.А., Гиниятов Ю.Р., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В. Полиморфизм ДНК собак (Canis familiaris L.). I. Происхождение, распространение собак в свете молекулярно-биологических данных об их митохондриальных и ядерных геномах // Biomics. 2021.  Т.13(3).  С.  298-308.  DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2021-21  
  10. Чемерис Д.А., Сагитов АМ., Аминев Ф.Г., Луценко В.И., Гарафутдинов Р.Р., Сахабутдинова А.Р., Василов Р.Г., Алексеев Я.И., Сломинский П.А., Хуснутдинова Э.К., Чемерис А.В. Эволюция подходов к ДНК-идентификации личности // Биомика. 2018. Т.10(1). С.85-140. DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2018-16 
  11. Aaspõllu A., Kelve M. The first criminal case in Estonia with dog's DNA data admitted as evidence // International Congress Series. 2003. V.1239(1). P.847- 851. DOI: https://doi.org/10.1016/S0531-5131(02)00224-8 
  12. Agrafioti I., Stumpf M.P.H. SNPSTR: a database of compound microsatellite-SNP markers // Nucleic Acids Res. 2007. V.35 (Database issue). D71-75. doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkl806 
  13.  Allwood J.S., Meredith E., Lindquist C., Breen M. Application of an established canine genotyping method to a sequence-based approach // Forensic Sci. Int.: Anim. Environm. 2021. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsiae.2021.100029.
  14. Altet L., Francino O., Sánchez A. Microsatellite polymorphism in closely related dogs // J. Hered. 2001. V. 92(3). P. 276-279. doi: https://doi.org/10.1093/jhered/92.3.276. 
  15.  Barrientos L.S., Crespi J.A., Fameli A., Posik D.M., Morales H., Peral García P., Giovambattista G. DNA profile of dog feces as evidence to solve a homicide // Leg. Med. (Tokyo). 2016. V. 22. P. 54-57. doi: https://doi.org/10.1016/j.legalmed.2016.08.002. 
  16. Bekaert B., Larmuseau M.H., Vanhove M.P., Opdekamp A., Decorte R. Automated DNA extraction of single dog hairs without roots for mitochondrial DNA analysis // Forensic Sci. Int. Genet. 2012. V. 6(2). P. 277- 281. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2011.04.009. 
  17. Berger B., Berger C., Hecht W., Hellmann A., Rohleder U., Schleenbecker U., Parson W. Validation of two canine STR multiplex-assays following the ISFG recommendations for non-human DNA analysis // Forensic Sci. Int. Genet. 2014. V. 8(1). P. 90-100. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2013.07.002.
  18. Berger B., Berger C., Heinrich J., Niederstätter H., Hecht W., Hellmann A., Rohleder U., Schleenbecker U., Morf N., Freire-Aradas A., McNevin D., Phillips C., Parson W. Dog breed affiliation with a forensically validated canine STR set // Forensic Sci. Int. Genet. 2018. V. 37. P. 126-134. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.08.005. 
  19. Berger B., Heinrich J., Niederstätter H., Hecht W., Morf N., Hellmann A., Rohleder U., Schleenbecker U., Berger C., Parson W. Forensic characterization and statistical considerations of the CaDNAP 13-STR panel in 1,184 domestic dogs from Germany, Austria, and Switzerland. CaDNAP Group // Forensic Sci. Int. Genet. 2019. V. 42. P. 90-98. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2019.06.017. 
  20. Berger C., Heinrich J., Berger B., Hecht W., Parson W. On Behalf Of CaDNAP. Towards Forensic DNA Phenotyping for Predicting Visible Traits in Dogs // Genes (Basel). 2021. V. 12(6). P. 908. doi: 10.3390/genes12060908 
  21. Binns M.M., Holmes N.G., Marti E., Bowen N. Dog parentage testing using canine microsatellites // J. Small Anim. Pract. 1995. V. 36(11). P. 493-497. doi: https://doi.org/10.1111/j.1748-5827.1995.tb02791.x   .  
  22. Blackie R., Taylor D., Linacre A. Successful direct amplification of nuclear markers from single dog hairs using DogFiler multiplex // Electrophoresis. 2015. V. 36(17). P. 2082-2085. doi: https://doi.org/10.1002/elps.201400560.
  23. Budowle B., Garofano P., Hellman A., Ketchum M., Kanthaswamy S., Parson W., van Haeringen W., Fain S., Broad T. Recommendations for animal DNA forensic and identity testing // Int. J. Legal Med. 2005. V. 119(5). P. 295-302. doi: https://doi.org/10.1007/s00414-005-0545-9. 
  24. Buitkamp J., Ammer H., Geldermann H. DNA fingerprinting in domestic animals // Electrophoresis. 1991. V. 12(2-3). P. 169-174. doi: https://doi.org/10.1002/elps.1150120212.
  25. Ciampolini R., Cecchi F., Spinetti I., Rocchi A., Biscarini F. The use of genetic markers to estimate relationships between dogs in the course of criminal investigations // BMC Res. Notes. 2017. V. 10(1). P. 414. doi: https://doi.org/10.1186/s13104-017-2722-6. 
  26.  Clarke M., Vandenberg N. Dog attack: the application of canine DNA profiling in forensic casework // Forensic Sci. Med. Pathol. 2010. V. 6(3). P. 151-157. doi: https://doi.org/10.1007/s12024-009-9114-8. 
  27. Dayton M., Koskinen M.T., Tom B.K., Mattila A.M., Johnston E., Halverson J., Fantin D., DeNise S., Budowle B., Smith D.G., Kanthaswamy S. Developmental validation of short tandem repeat reagent kit for forensic DNA profiling of canine biological material // Croat. Med. J. 2009. V. 50(3). P. 268-285. doi: https://doi.org/10.3325/cmj.2009.50.268. 
  28. DeNise S., Johnston E., Halverson J., Marshall K., Rosenfeld D., McKenna S., Sharp T., Edwards J. Power of exclusion for parentage verification and probability of match for identity in American Kennel Club breeds using 17 canine microsatellite markers // Anim. Genet. 2004. V. 35(1). P. 14-7. doi: https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.2003.01074.x.
  29. Dobosz M., Lancia M., Coletti A., Grasso C., Panarese F., De Iuliis P. Genetic typing of dogs’ traces in biological samples // Forensic Sci. 2009. P. 283-285. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2009.07.004 
  30. Eggleston M.L., Irion D.N., Schaffer A.L., Hughes S.S., Draper J.E., Robertson K.R., Millon L.V., Pedersen N.C. PCR multiplexed microsatellite panels to expedite canine genetic disease linkage analysis // Anim. Biotechnol. 2002. V. 13(2). P. 223-235. doi: https://doi.org/10.1081/ABIO-120016191
  31. Eichmann C., Berger B., Parson W. A proposed nomenclature for 15 canine-specific polymorphic STR loci for forensic purposes // Int. J. Legal Med. 2004. V. 118(5). P. 249-266. doi: https://doi.org/10.1007/s00414-004-0452-5 
  32. Eichmann C., Berger B., Parson W. Relevant aspects for forensic STR analysis of canine DNA: Repeat- based nomenclature and sensitive PCR multiplexes // Int. Congress Series 2006. https://doi.org/10.1016/j.ics.2005.11.032 .   
  33. Eichmann C., Berger B., Reinhold M., Lutz M., Parson W. Canine-specific STR typing of saliva traces on dog bite wounds // Int. J. Legal Med. 2004. V. 118(6). P. 337-42. doi: https://doi.org/10.1007/s00414-004-0479-7.
  34. Eichmann C., Berger B., Steinlechner M., ParsonW. Estimating the probability of identity in a random dog population using 15 highly polymorphic canine STR markers // Forensic Sci. Int. 2005. V. 151(1). P. 37-44. doi: https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2004.07.002. 
  35. Evans J.J., Wictum E.J., Penedo M.C., Kanthaswamy S. Real-time polymerase chain reaction quantification of canine DNA // J. Forensic Sci. 2007. V. 52(1). P. 93-96. doi: https://doi.org/10.1111/j.1556-4029.2006.00305.x. 
  36. Eyles J. Validation and Database Generation of 100 Canine Microsatellite Profiles for Crime and Paternity Testing. A thesis submitted in fulfilment of the requirements of the degree of Master of Forensic Science (Professional Practice) In the School of Veterinary and Life Sciences Murdoch University. Semester 2, 2019.
  37. Francisco L.V., Langston A.A., Mellersh C.S., Neal C.L., Ostrander E.A. A class of highly polymorphic tetranucleotide repeats for canine genetic mapping // Mamm. Genome. 1996. V. 7(5). P. 359-362. doi: https://doi.org/10.1007/s003359900104.
  38. Fredholm M., Winterø A.K. Variation of short tandem repeats within and between species belonging to the Canidae family // Mamm. Genome. 1995. V. 6(1). P. 11-18. doi: https://doi.org/10.1007/BF00350887.
  39. Ganço L., Carvalho M., Serra A., Balsa F., Bento A.M., Anjos M.J., Xufre A., Côrte-Real F. Genetic diversity analysis of 10 STR's loci used for forensic identification in canine hair samples // Forensic Sci. 2009. https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2009.08.068. 
  40. Gentilini F., Turba M.E., Andreani G. DNA fingerprinting using microsatellites to solve a parentage testing in the boxer breed // Vet. Res. Commun. 2004. V. 28. P.185-188. doi: 10.1023/b:verc.0000045402.24840.71. \   Georges M., Hilbert P., Lequarré A.S., Leclerc V., Hanset R., Vassart G. Use of DNA bar codes to resolve a canine paternity dispute // J. Am. Vet. Med. Assoc. 1988. V. 193(9). P. 1095-1098. 
  41. Georges M., Lequarré A.S, Castelli M., Hanset R., Vassart G. DNA fingerprinting in domestic animals using four different minisatellite probes // Cytogenet. Cell. Genet. 1988. V. 47(3). P. 127-131. doi: https://doi.org/10.1159/000132529.  
  42. Gill P., Jeffreys A.J., Werrett D.J. Forensic application of DNA 'fingerprints' // Nature. 1985. V. 318(6046). P. 577-579. doi: https://doi.org/10.1038/318577a0.
  43. Goleman M., Balicki I., Radko A., Rozempolska- Rucińska I., Zięba G. Pedigree and Molecular Analyses in the Assessment of Genetic Variability of the Polish Greyhound // Animals (Basel). 2021. V. 11(2). P. 353. doi: https://doi.org/10.3390/ani11020353.
  44. Halverson J.L., Basten C. A PCR multiplex and database for forensic DNA identification of dogs // J. Forensic Sci. 2005. V. 50(2). P. 352-363. 
  45. Halverson J.L., Basten C. Forensic DNA identification of animal-derived trace evidence: tools for linking victims and suspects // Croat. Med. J. 2005. V. 46(4). P. 598-605. 
  46.  Hart M.L., Meyer A., Johnson P.J., Ericsson A.C. Comparative Evaluation of DNA Extraction Methods from Feces of Multiple Host Species for Downstream Next-Generation Sequencing // PLoS One. 2015. V. 10(11). e0143334. doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0143334.  
  47. Hellmann A.P., Rohleder U., Eichmann C., Pfeiffer I., Parson W., Schleenbecker U. A proposal for standardization in forensic canine DNA typing: allele nomenclature of six canine-specific STR loci // J. Forensic Sci. 2006. V. 51(2). P.274-281. doi: https://doi.org/10.1111/j.1556- 4029.2006.00049.x. 
  48. Hermans I.F., Atkinson J., Hamilton J.F., Chambers G.K. Three cases of disputed paternity in dogs resolved by the use of DNA fingerprinting // N. Z. Vet J. 1991.    V.    39(2).    P.    61-64.    doi: https://doi.org/10.1080/00480169.1991.35662  
  49. Heß SA, Trapani S, Boronat MDM, Theunissen GMG, Rolf B, Jäger R. Ribosomal DNA as target for the assessment of DNA degradation of human and canine DNA // Leg. Med (Tokyo). 2021. 48. 101819. doi: https://doi.org/10.1016/j.legalmed.2020.101819 
  50. Holmes N.G., Dickens H.F., Parker H.L., Binns M.M., Mellersh C.S., Sampson J. Eighteen canine microsatellites // Anim. Genet. 1995. V. 26(2). P. 132- 133. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1995.tb02659.x.  
  51. Holmes N.G., Humphreys S.J., Binns M.M., Curtis R., Holliman A., Scott A.M. Characterization of canine microsatellites // EXS. 1993. V. 67. P. 415-420. doi: https://doi.org/10.1007/978-3-0348-8583-6_41. 
  52. Holmes N.G., Mellersh C.S., Humphreys S.J., Binns M.M., Holliman A., Curtis R., Sampson J. Isolation and characterization of microsatellites from the canine genome // Anim. Genet. 1993. V. 24(4). P. 289-292. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1993.tb00313.x.  
  53. Holmes N.G., Strange N.J., Binns M.M., Mellersh C.S., Sampson J. Three polymorphic canine microsatellites // Anim Genet. 1994 . V. 25(3). P. 200. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1994.tb00122.x. 
  54. Ichikawa Y., Takagi K., Tsumagari S., Ishihama K., Morita M., Kanemaki M., Takeishi M., Takahashi H. Canine parentage testing based on microsatellite polymorphisms // J. Vet. Med. Sci. 2001. V. 63(11). P. 1209-1213. doi: https://doi.org/10.1292/jvms.63.1209.  
  55. Ichikawa Y., Takahashi Y., Tsumagari S., Takeishi M., Ishihama K., Morita M., Kanemaki M., Minezawa M., Takahashi H. Identification and characterization of 40 dinucleotide microsatellites in the dog genome // Anim. Genet. 2002. V. 33(5). P. 400-401. doi: https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.2002.00896_16.x.  
  56. Irion D.N., Schaffer A.L., Famula T.R., Eggleston M.L., Hughes S.S., Pedersen N.C. Analysis of genetic variation in 28 dog breed populations with 100 microsatellite markers // J. Hered. 2003. V. 94(1). P. 81- 87. doi: https://doi.org/10.1093/jhered/esg004. 
  57. Jäger R., Heß S.A., Trapani S., Rolf B., Boronat M.D.M., Theunissen G.M.G. Ribosomal DNA as target for the assessment of DNA degradation of human and canine DNA // Leg. Med. (Tokyo). 2021. V. 48. 101819. doi: https://doi.org/10.1016/j.legalmed.2020.101819. 
  58. Jakubczak A., Jezewska G. Walidacja zestawu StockMarks® do identyfikacji osobniczej zwierz¹t z rodziny psowatych // Medycyna Wet. 2008. V. 64(6). P. 832-835. 
  59. Jeffreys A.J., Brookfield J.F., Semeonoff R. Positive identification of an immigration test-case using human DNA fingerprints // Nature. 1985. V. 317(6040). P. 818-819. doi: https://doi.org/10.1038/317818a0. 
  60. Jeffreys A.J., Morton D.B. DNA fingerprints of dogs and cats // Anim. Genet. 1987. V. 18(1). P. 1-15. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1987.tb00739.x.  
  61. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable 'minisatellite' regions in human DNA // Nature. 1985. V. 314(6006). P. 67-73. doi: https://doi.org/10.1038/314067a0.  
  62. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Individual- specific 'fingerprints' of human DNA // Nature. 1985. V. 316(6023). P. 76-9. doi: https://doi.org/10.1038/316076a0. 
  63. Kanthaswamy S. Review: domestic animal forensic genetics - biological evidence, genetic markers, analytical approaches and challenges // Anim. Genet. 2015. V. 46(5). P. 473-84. doi: https://doi.org/10.1111/age.12335. 
  64. Kanthaswamy S. The Development and Validation of a Standardized Canine STR Panel for Use in Forensic Casework / 2009. 63 P. NIJ Grant No. 2004-DN- BX-K007). 
  65. Kanthaswamy S., Oldt R.F., Montes M., Falak A. Comparing two commercial domestic dog (Canis familiaris) STR genotyping kits for forensic identity calculations in a mixed-breed dog population sample // Anim. Genet. 2019. V. 50(1). P. 105-111. doi: https://doi.org/10.1111/age.12758.  
  66.  Kanthaswamy S., Premasuthan A. Quadriplex real-time PCR (qPCR) assay for human-canine-feline species identification and nuclear DNA quantification // Forensic Sci. Int. Genet. 2012. V. 6(3). e97-8. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2011.09.001. 
  67. Kanthaswamy S., Premasuthan A., Ng J., Satkoski J., Goyal V. Quantitative real-time PCR (qPCR) assay for human-dog-cat species identification and nuclear DNA quantification // Forensic Sci. Int. Genet. 2012. V. 6(2). P. 290-295. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2011.06.005  
  68. Kanthaswamy S., Tom B.K., Mattila A.M., Johnston E., Dayton M., Kinaga J., Erickson B.J., Halverson J., Fantin D., DeNise S., Kou A., Malladi V., Satkoski J., Budowle B., Smith D.G., Koskinen M.T. Canine population data generated from a multiplex STR kit for use in forensic casework // J. Forensic Sci. 2009. V.54(4).    P.    829-840.  doi: https://doi.org/10.1111/j.1556-4029.2009.01080.x. 
  69. Kim K.S., Tanabe Y., Park C.K., Ha J.H. Genetic variability in East Asian dogs using microsatellite loci analysis // J. Hered. 2001. V. 92(5). P. 398-403. doi: https://doi.org/10.1093/jhered/92.5.38.9.  
  70. Koskinen M.T. Individual assignment using microsatellite DNA reveals unambiguous breed identification in the domestic dog // Anim. Genet. 2003. V. 34(4). P. 297-301. doi: м10.1046/j.1365-2052.2003.01005.x.  
  71. Koskinen M.T., Bredbacka P. A convenient and efficient microsatellite-based assay for resolving parentages in dogs // Anim. Genet. 1999. V. 30(2). P. 148- 149. doi: https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.1999.00438.x.  
  72. Koskinen M.T., Bredbacka P. Assessment of the population structure of five Finnish dog breeds with microsatellites // Anim. Genet. 2000. V. 31(5). P. 310-7. doi: https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.2000.00669.x.
  73. Kun T., Lyons L.A., Sacks B.N., Ballard R.E., Lindquist C., Wictum E.J. Developmental validation of Mini-DogFiler for degraded canine DNA // Forensic Sci. Int. Genet. 2013. V. 7(1). P. 151-158. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2012.09.002. 
  74. Lee M., Hwang I.K., Jung J.Y., Kim J.Y., Chang M., Moon S. Construction of an in-house allelic ladder for Canine Genotypes Panel 2.1 Kit // J. Forensic Sci. 2021. V. 66(6). P. 2362-2368. doi: https://doi.org/10.1111/1556-4029.14812. 
  75. Liang J.W., Coyle H.M. A short interspersed nuclear element-based quantitative PCR assay for simultaneous human and dog DNA detection and quantification // Biotechniques. 2021. V. 70(3). P. 175- 180. doi: https://doi.org/10.2144/btn-2020-0144. 
  76. Linacre A., Gusmão L., Hecht W., Hellmann A.P., Mayr W.R., Parson W., Prinz M., Schneider P.M., Morling N. ISFG: recommendations regarding the use of non-human (animal) DNA in forensic genetic investigations // Forensic Sci. Int. Genet. 2011. V. 5(5). P. 501-505. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2010.10.017. 
  77. Lindblad-Toh K. et al. Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog // Nature. 2005. V. 438. P. 803-819. doi: https://doi.org/10.1038/nature04338 
  78. Lindquist C.D., Wictum E.J. Less is More - Optimization of DNA Extraction from Canine Feces // J. Forensic Sci. 2016. V. 61(1). P. 212-218. doi: https://doi.org/10.1111/1556-4029.12913. 80.    Mariat D., Amigues Y., Boscher M.Y. Eight canine tetranucleotide repeats // Anim. Genet. 1998. V. 29(2). P. 156-157.    
  79. Mariat D., Kessler J.L., Vaiman D., Panthier J.J. Polymorphism characterization of five canine microsatellites // Anim. Genet. 1996. V. 27(6). P. 434- 435. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1996.tb00514.x.
  80. Mariat D., Robert L. Dog genetic polymorphism revealed by synthetic tandem repeats // EXS. 1993. V. 67. P. 411-414. doi: https://doi.org/10.1007/978-3-0348-8583-6_40. 
  81. Mitsouras K., Faulhaber E.A. Saliva as an alternative source of high yield canine genomic DNA for genotyping studies // BMC Res. Notes. 2009. V. 29. P. 219. doi: https://doi.org/10.1186/1756-0500-2-219. 
  82. Molyneux K., Batt R.M. Five polymorphic canine microsatellites // Anim. Genet. 1994. V. 25(5). P. 379. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1994.tb00395.x. 
  83. Moon S.H., Jang Y.J., Han M.S., Cho M.H. Population genetic study of 10 short tandem repeat loci from 600 domestic dogs in Korea // J. Vet. Sci. 2016. V. 17(3). P. 391-398. doi: https://doi.org/10.4142/jvs.2016.17.3.391. 
  84. Morera L., Barba C.J., Garrido J.J., Barbancho M., de Andrés D.F. Genetic variation detected by microsatellites in five Spanish dog breeds // J. Hered. 1999. V. 90(6). P. 654-656. doi: https://doi.org/10.1093/jhered/90.6.654
  85. Müller S., Flekna G., Müller M., Brem G. Use of canine microsatellite polymorphisms in forensic examinations // J. Hered. 1999. V. 90(1). P. 55-56. doi: https://doi.org/10.1093/jhered/90.1.55.  
  86. Ogden R., Mellanby R.J., Clements D., Gow A.G., Powell R., McEwing R. Genetic data from 15 STR loci for forensic individual identification and parentage analyses in UK domestic dogs (Canis lupus familiaris) // Forensic Sci. Int. Genet. 2012. V. 6(2). e63-5. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2011.04.015. 
  87. Ostrander E.A., Mapa F.A., Yee M., Rine J. One hundred and one new simple sequence repeat-based markers for the canine genome// Mamm Genome. 1995. V.6(3). P.192-5. doi: https://doi.org/10.1007/BF00293011. 
  88. Ostrander EA, Sprague GF Jr, Rine J. Identification and characterization of dinucleotide repeat (CA)n markers for genetic mapping in dog // Genomics. 1993. V.16(1). P.207-213. doi: https://doi.org/10.1006/geno.1993.1160. 
  89. Pádár Z., Egyed B., Kontadakis K., Füredi S., Woller J., Zöldág L., Fekete S. Canine STR analyses in forensic practice. Observation of a possible mutation in a dog hair // Int. J. Legal Med. 2002. V. 116(5). P. 286-8. doi: https://doi.org/10.1007/s00414-002-0302-2. 
  90. Parker H.G., Kim L.V., Sutter N.B., Carlson S., Lorentzen T.D., Malek T.B., Johnson G.S., DeFrance H.B., Ostrander E.A., Kruglyak L. Genetic structure of the purebred domestic dog // Science. 2004. V. 304(5674). P. 1160-1164. doi: https://doi.org/10.1126/science.1097406.  
  91. Parra D., García D., Mendez S., Cañon J., Dunner S. High Mutation Rates in Canine Tetranucleotide Microsatellites: Too Much Risk for Genetic Compatibility Purposes? // The Open Forensic Science Journal. 2010. V. 3. P.9-13.
  92. Parra D., Méndez S., Cañón J., Dunner S. Genetic differentiation in pointing dog breeds inferred from microsatellites and mitochondrial DNA sequence //Anim. Genet. 2008. V. 39(1). P. 1-7. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2007.01658.x. 
  93. Pfeiffer I., Völkel I., Täubert H., Brenig B. Forensic DNA-typing of dog hair: DNA-extraction and PCR amplification // Forensic Sci. Int. 2004. V. 141(2-3). P. 149-51. doi: https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2004.01.016. 
  94. Pribánová M., Horák P., Schröffelová D., Urban T., Bechynová R., Musilová L. Analysis of genetic variability in the Czech Dachshund population using microsatellite markers // J. Anim. Breed. Genet. 2009. V. 126(4).   P.   311-318.   doi: https://doi.org/10.1111/j.1439-0388.2008.00772.x. 
  95. Primmer C.R., Matthews M.E. Canine tetranucleotide repeat polymorphism at the VIAS-D10 locus // Anim. Genet. 1993. V. 24(4). P. 332. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1993.tb00334.x. 
  96. Radko A., Podbielska A. Microsatellite DNA Analysis of Genetic Diversity and Parentage Testing in the Popular Dog Breeds in Poland // Genes (Basel). 2021. V. 12(4). P. 485. doi: https://doi.org/10.3390/genes12040485
  97. Radko A., Rubiś D., Szumiec A. Analysis of microsatellite DNA polymorphism in the Tatra Shepherd Dog // J. Appl. Anim. Res. 2017. V. 46(1). P. 1-3. doi: https://doi.org/10.1080/09712119.2017.1292912
  98. Ryskov A.P., Jincharadze A.G., Prosnyak M.I., Ivanov P.L., Limborska S.A. M13 phage DNA as a universal marker for DNA fingerprinting of animals, plants and microorganisms // FEBS Lett. 1988. V. 233(2). P. 388-392. doi: https://doi.org/10.1016/0014-5793(88)80467-8. 
  99. Scharnhorst G., Kanthaswamy S. An assessment of scientific and technical aspects of closed investigations of canine forensics DNA--case series from the University of California, Davis, USA // Croat. Med. J. 2011. V. 52(3). P. 280-292. doi: https://doi.org/10.3325/cmj.2011.52.280.  
  100. Shibuya H., Collins B.K., Huang T.H., Johnson G.S. A polymorphic (AGGAAT)n tandem repeat in an intron of the canine von Willebrand factor gene // Anim. Genet. 1994. V. 25(2). P. 122. doi: https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1994.tb00094.x  .   
  101. Shutler G.G., Gagnon P., Verret G., Kalyn H., Korkosh S., Johnston E., Halverson J. Removal of a PCR inhibitor and resolution of DNA STR types in mixed human-canine stains from a five year old case // J. Forensic Sci. 1999. V. 44(3). P. 623-626.
  102. Somnay V., Duong T., Tsao R.Y., Prahlow J.A. Crime Scene Analysis Through DNA Testing of Canine Feces-A Case Report // Acad. Forensic Pathol. 2020. V. 10(1). P. 56-61. doi: https://doi.org/10.1177/1925362120944743. 
  103. Sutton M.D., Holmes N.G., Brennan F.B., Binns M.M., Kelly E.P., Duke E.J. A comparative genetic analysis of the Irish greyhound population using multilocus DNA fingerprinting, canine single locus minisatellites and canine microsatellites // Anim. Genet. 1998.  V.  29(3).  P.  168-172.  doi:  https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.1998.00286.x.  
  104. Tsuji A., Ishiko A., Kimura H., Nurimoto M., Kudo K., Ikeda N. Unusual death of a baby: a dog attack and confirmation using human and canine STRs // Int. J. Legal Med. 2008. V. 122(1). P. 59-62. doi: https://doi.org/10.1007/s00414-006-0150-6.  
  105. van Asch B., Alves C., Gusmão L., Pereira V., Pereira F., Amorim A. A new autosomal STR nineplex for canine identification and parentage testing // Electrophoresis. 2009. V. 30(2). P. 417-423. doi: https://doi.org/10.1002/elps.200800307. 
  106. van Asch B., Alves C., Pereira F., Gusmão L., Amorim A. A new autosomal STR multiplex for canine genotyping // Forensic Sci. Int.: Genet. Suppl. Series. 2008. P. 628-629. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigss.2007.10.043. 
  107. van Asch B., Pereira F. State-of-the-art and future prospects of canine STR-based genotyping // Open Forensic Sci.  J.  2010. doi: https://doi.org/10.2174/1874402801003010045. 
  108. van Asch B., Pinheiro R., Pereira R., Alves C., Pereira V., Pereira F., Gusmão L., Amorim A. A framework for the development of STR genotyping in domestic animal species: characterization and population study of 12 canine X-chromosome loci // Electrophoresis. 2010. V. 31(2). P. 303-308. doi: https://doi.org/10.1002/elps.200900389. 
  109. Vassart G., Georges M., Monsieur R., Brocas H., Lequarre A.S., Christophe D. A sequence in M13 phage detects hypervariable minisatellites in human and animal DNA // Science. 1987. V. 235(4789). P. 683-684. doi: https://doi.org/10.1126/science.2880398. 
  110. Vergnaud G., Mariat D., Apiou F., Aurias A., Lathrop M., Lauthier V. The use of synthetic tandem repeats to isolate new VNTR loci: cloning of a human hypermutable sequence // Genomics. 1991. V. 11(1). P. 135-144. doi: https://doi.org/10.1016/0888-7543(91)90110-z. 
  111. Wang M.L., Jin X.Y., Xiong X., Yang J.L., Li J.P., Wang Q., Zhu B.F., Deng Y.J. Polymorphism analyses of 19 STRs in Labrador Retriever population from China and its heterozygosity comparisons with other retriever breeds // Mol. Biol. Rep. 2019. V. 46(2). P. 1577-1584. doi: https://doi.org/10.1007/s11033-019-04601-4.  
  112. Wictum E., Kun T., Lindquist C., Malvick J., Vankan D., Sacks B. Developmental validation of DogFiler, a novel multiplex for canine DNA profiling in forensic casework // Forensic Sci. Int. Genet. 2013. V. 7(1). P. 82-91. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2012.07.001. 
  113. Wong A.K., Ruhe A.L., Dumont B.L., Robertson K.R., Guerrero G., Shull S.M., Ziegle J.S., Millon L.V., Broman K.W., Payseur B.A., Neff M.W. A comprehensive linkage map of the dog genome // Genetics.    2010.    V.    184(2).    P.    595-605.    doi: https://doi.org/10.1534/genetics.109.106831. 
  114. Zajc I., Mellersh C., Kelly E.P., Sampson J. A new method of paternity testing for dogs, based on microsatellite sequences // Vet. Records. 1994. V. 135(23). P. 545-7.
  115. Zajc I., Mellersh C.S., Sampson J. Variability of canine microsatellites within and between different dog breeds // Mamm. Genome. 1997. V. 8(3). P. 182-5. doi: https://doi.org/10.1007/s003359900386. 
  116. Zajc I., Sampson J. DNA microsatellites in domesticated dogs: application in paternity disputes // Pflugers Arch. 1996. V. 431(6 Suppl 2). R201-2. doi: https://doi.org/10.1007/BF02346338. 
  117. Zajc I., Sampson J., Hered J. Utility of canine microsatellites in revealing the relationships of pure bred dogs  //  1999.  V.  90(1).  P.  104-107.  doi: https://doi.org/10.1093/jhered/90.1.104. 
  118. Zenke P., Egyed B., Zöldág L., Pádár Z. Population genetic study in Hungarian canine populations using forensically informative STR loci // Forensic Sci. Int. Genet. 2011. V. 5(1). e31-6. doi: https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2010.03.013. 
Скачать pdf
наверх
eISSN: 2221-6197 DOI: 10.31301/2221-6197