Biomics

Определена нуклеотидная последовательность хлоропластного генома диплоидной пшеницы Triticum sinskajae A.Filat. et Kurk. размером 136885 п.н. Проведенное сравнение собранного генома пшеницы Синской с хлоропластными геномами некоторых ди- и полиплоидных видов пшенично-эгилопсного альянса выявило высокую эволюционную консервативность и близость к пластидному геному T.monococcum, тогда как другая диплоидная пшеница T.urartu несколько удалена от них. Выравнивание нуклеотидных последовательностей полных хлоропластных геномов диплоидных пшениц с таковыми диплоидных эгилопсов из секций Sitopsis и Vertebrata, а также с тетра- и гексаплоидными пшеницами из рядов turgidum-aestivum и timopheevii позволило установить, что материнскими формами при их образовании послужили разные эгилопсы из подсекции Truncata, близкие к нынешнему Aegilops speltoides, но не он сам.

пшеница, эгилопс, Triticum sinskajae, T.monococcum, T.urartu, Aegilops speltoides, пшенично-эгилопсный альянс, филогеномика, хлоропластный геном, доноры геномов, субгеном, секвенирование

1. Кулуев А.Р., Матниязов Р.Т., Никоноров Ю.М., Чемерис А.В. Выделение геномной ДНК Nicotiana tabacum, обогащенной хлоропластной ДНК с использованием сахарозного градиента // Известия Уфимского научного центра Российской академии наук. 2018. № 2. С. 71-75. doi: 10.31040/2222-8349-2018-0-2-71-75
2. Кулуев А.Р., Матниязов Р.Т., Чемерис Д.А., Чемерис А.В. Современные представления о родственных взаимоотношениях в пшенично-эгилопсном альянсе (с краткой исторической справкой) // Biomics. 2016. Т. 8. № 4. С. 297-310.
3. Филатенко А.А., Куркиев У.К. Пшеница Синской (Новый вид – Triticum sinskajae Filat. et Kurk.) // Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 1975. T.54(1). С. 239–241.
4. Филатенко А.А., Чухина И.Г. Типовые образцы рода Triticum в гербарной коллекции ВИР (WIR): Часть I // Turczaninowia. 2013. Т. 16. № 3. С. 025-033. doi: 10.14258/turczaninowia.16.3.5
5. Bernhardt N., Brassac J., Kilian B., Blattner F.R. Dated tribe-wide whole chloroplast genome phylogeny indicates recurrent hybridizations within Triticeae // BMC Evol Biol. 2017. 17(1):141. doi: 10.1186/s12862-017-0989-9
6. Chen N., Chen W.J., Yan H., Wang Y., Kang H.Y., Zhang H.Q., Zhou Y.H., Sun G.L., Sha L.N., Fan X. Evolutionary patterns of plastome uncover diploid-polyploid maternal relationships in Triticeae // Mol. Phylogenet. Evol. 2020. V.149. 106838. doi: 10.1016/j.ympev.2020.106838
7. Chevreux B., Pfisterer T., Drescher B., Driesel A. J., Müller W. E., Wetter T., Suhai S. Using the miraEST Assembler for Reliable and Automated mRNA Transcript Assembly and SNP Detection in Sequenced ESTs // Genome Res. 2004. V.14(6). P. 1147–1159. doi: 10.1101/gr.1917404
8. Gornicki P., Zhu H., Wang J., Challa G.S., Zhang Z., Gill B.S., Li W. The chloroplast view of the evolution of polyploid wheat // New Phytol. 2014. V.204(3). P.704-714. doi: 10.1111/nph.12931
9. Middleton C.P., Senerchia N., Stein N., Akhunov E.D., Keller B., Wicker T., Kilian B. Sequencing of chloroplast genomes from wheat, barley, rye and their relatives provides a detailed insight into the evolution of the Triticeae tribe // PLoS One. 2014. V.9(3). e85761. doi: 10.1371/journal.pone.0085761