eISSN: 2221-6197 DOI: 10.31301/2221-6197

Biomics

Архив номеров

Индексирование
  1. Главная
  2. →
  3. 2018
  4. →
  5. Том 10, № 3
  6. →
  7. Статьи
  8. →
  9. Молекулярные маркеры, применяемые для определения генетического разнообразия и видоидентификации дикорастущих растений

Молекулярные маркеры, применяемые для определения генетического разнообразия и видоидентификации дикорастущих растений

Год: 2018

Страницы: 290-318

Номер: Том 10, № 3

Тип: научная статья

DOI: https://doi.org/10.31301/2221-6197.bmcs.2018-39

Рубрика: Статьи

Авторы: Кулуев Азат Разяпович, Кулуев Булат Разяпович, Нигматуллина Н.В.!

Скачать pdf

Аннотация:

Видоидентификация и оценка внутривидового генетического полиморфизма являются важнейшими задачами не только современной генетики растений, но и науки о растениях в целом. Для решения этих задач было разработано большое число разнообразных методов поиска и исследования таксономически значимых участков ДНК, которые получили название молекулярных или ДНК-маркеров. Данный обзор посвящен рассмотрению наиболее популярных методов изучения ДНК-маркеров дикорастущих растений с использованием технологий полимеразной цепной реакции (ПЦР), ДНК-чипирования и секвенирования. Из методов, основанных на ПЦР, наибольшее распространение получили ISSR, RAPD, SSR, AFLP, IRAP и REMAP, причем эти методы применяют как для оценки генетического разнообразия, так и при видоидентификации. Более эффективным для изучения внутривидового полиморфизма является SNP-анализ, который обычно проводится методом ДНК-чипирования. Стремительный рост исследований связанных с SNP-анализом говорит о том, что эта группа методов в скором времени, возможно, полностью вытеснит классические методы ПЦР-фингерпринтинга. Для видоидентификации дикорастущих растений довольно эффективен метод секвенирования вариабельных таксономически значимых фрагментов ДНК. Для этого чаще всего применяют хлоропластные маркеры rpoB, rpoC1, rbcL, matK, psbK-psbI, trnH-psbA, atpF-atpH и ядерные маркеры ITS1 и ITS2. Ни один из этих маркеров не претендует на универсальность, поэтому при филогенетических построениях используют одновременный анализ нескольких ДНК-маркеров, причем вспомогательную роль при этом могут выполнять методы ПЦР-фингерпринтинга. Полногеномное секвенирование вместе с компьютерным анализом полученных данных при условии уменьшения стоимости и трудоемкости в будущем могут заменить все современные методы оценки генетического полиморфизма, основанные на ПЦР и ДНК-чипировании, а также все методы видоидентификации, использующие метод секвенирования таксономически значимых хлоропластных и ядерных маркеров.

Ключевые слова:

молекулярные маркеры, ДНК-маркеры, генетический полиморфизм, видоидентификация, фингерпринтинг, ISSR, RAPD, SSR, AFLP, IRAP, REMAP, хлоропластные маркеры, ITS

Библиографический список:

  1. Александров О.С., Дивашук М.Г., Карлов Г.И. Создание пол-специфичного молекулярного маркера для хмеля японского Humulus japonicus Siebold and Zucc. // Генетика. 2011.T. 47. С. 1145-1149. DOI:10.1134/S1022795411080023 @@ Aleksandrov O.S., Divashuk M.G., Karlov G.I. Development of a sex-specific molecular marker for Japanese hop Humulus japonicus Siebold and Zucc. Russian Journal of Genetics. 2011. Т. 47. № 8. P. 1016-1020. DOI:10.1134/S1022795411080023 @@ Sulimova G.E. DNK-markers in genetic studies: types of markers, their characteristics and application. Uspekhi Sovremennoy Biologii. 2011. V. 9. P. 32-43.
  2. Алтухов Ю.П., Салменкова Е.А. Полиморфизм ДНК в популяционной генетике // Генетика. 2002. Т. 38. С.1173-1195. @@ Altukhov Yu.P., Salmenkova E.A. DNA polymorphism in population genetics. Russian Journal of Genetics. 2002. V. 38. P. 989-1008. DOI:10.1023/A:1020288812170
  3. Андреев И.О., Спиридонова Е.В., Киръяченко С.С., Парникоза И.Ю., Майданюк Д.Н., Волков Р.А., Козерецкая И.А., Кунах В.А. Популяционно-генетический анализ Deschampsia antarctica из двух регионов приморской Антарктики // Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. 2010. №4. С. 88-91. @@ Andreev I.O., Spiridonova E.V., Kyryachenko S.S., Parnikoza I.Yu., Maidaniuk D.N., Volkov R.A., Kozeretska I.A., Kunakh V.A. Population genetic analysis of Deschampsia antarctica from two regions of maritime Antarctica. Bulletin of Moscow University. Series 16: Biology. 2010. № 4. P. 88-91.
  4. Баймухаметова Э.А., Лаштабова С.В., Головина В.Ю., Кимсанбаев О.Х., Кулуев Б.Р. Применение индуцированного мутагенеза для увеличения генетического полиморфизма хлопчатника // Биомика. 2017. Т. 9. № 4. 370-379. @@ Baimuhametova E.A., Lashtabova S.V., Golovina V.Y., Kimsanbaev O.H., Kuluev B.R. Application of induced mutagenesis for increasing the genetic polymorphism of cotton. Biomics. 2017. V.9. No. 4. P. 370-379.
  5. Байрамгулова З.Х., Редькина Н.Н., Байрамгулов Н.Р. Особенности генофонда солодки Коржинского на юго-востоке Башкортостана // Актуальные проблемы генетики и молекулярной биологии. Материалы всероссийской молодежной конференции в рамках федеральной целевой программы "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009-2013 годы. ФГБОУ ВПО "Башкирский государственный аграрный университет". 2010 С. 32-37. @@ Bayramgulova Z.Kh., Redkina N.N., Bayramgulov N.R. Features of the gene pool of licorice Korzhinsky in the south-east of Bashkortostan. Actual problems of genetics and molecular biology. Materials of the All-Russian Youth Conference in the framework of the federal target program "Scientific and scientific-pedagogical personnel of innovative Russia" for 2009-2013. FGBOU VPO "Bashkir State Agrarian University". 2010. P. 32-37.
  6. Бобошина И.В., Боронникова С.В. Изучение генетического полиморфизма некоторых сортов Triticum aestivum L. с использованием ISSR-маркеров // Аграрный вестник Урала. 2012. № 5. С. 19-20. @@ Boboshina I.V., Boronnikova S.V. Studying of genetic polymorphism of some grades Triticum aestivum L. with use of ISSR-markers. Agrarian Bulletin of the Urals. 2012. No. 5. P. 19-20.
  7. Боронникова С.В. Генетическая паспортизация популяций редких видов растений рода Adonis с использованием ISSR- и IRAP-маркеров // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. № 1. 2009. С. 82-88. @@ Boronnikova S.V. Genetic certification of populations of rare species of plants of the genus Adonis using ISSR- and IRAP markers. Izvestia of Timiryazev Agricultural Academy. No. 1. 2009. P. 82-88.
  8. Боронникова С.В. Генетическая паспортизация редких и нуждающихся в охране видов растений как основа оптимизации сохранения их генофондов // Вопросы современной науки и практики. Университет им. В.И. Вернадского. 2009. №. 3. С. 8-17. @@ Boronnikova S.V. Genetic certification of rare and endangered species of plants as basis for their gene pool preservation optimization. Questions of modern science and practice. Vernadsky University. 2009. No. 3. P. 8-17.
  9. Боронникова С.В., Кокаева З.Г., Тихомирова Н.Н., Смирнова А.В., Бойкова А. А. Молекулярно-генетический анализ популяций редкого лекарственного вида Adonis sibirica Patrin еx Ledeb. на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Успехи современной биологии. 2010. Т. 130. №5. С. 481-486. @@ Boronnikova S.V., Kokaeva Z.G., Tikhomirova N.N., Smirnova A. V., Boikova A. A. Molecular-genetic analysis of a rare medicinal plant species (Adonis sibirica) based on polymorphism of ISSR markers. Uspekhi Sovremennoi Biologii. 2010. V. 130. No. 5. P. 481-486.
  10. Боронникова С.В., Нечаева Ю.С. Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редкого вида растений пермского края Adenophora lilifolia (l.) А. DC. // Вестник Пермского университета. Пермь. 2012. C. 41-44. @@ Boronnikova S.V., Nechaeva Yu.S. The molecular-genetic identification and sertification of rare species of plants of Perm krai Adenophora lilifolia (L.) А. DC. Bulletin of Perm University. 2012. P. 41-44.
  11. Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края: монография / Перм. ГоС. Нац. Исслед. Ун-т. Пермь. 2013. 239 c. @@ Boronnikova S.V. Molecular genetic analysis and assessment of the state of the gene pools of plant species of the Perm region: monograph. Perm State National Research University. Permian. 2013. 239 p.
  12. Вахитов В.А., Чемерис А.В., Сабиржанов Б.Е., Ахунов Э.Д., Куликов А.М., Никоноров Ю.М., Гималов Ф.Р., Бикбулатова С.М., Баймиев А.Х. Филогенетические взаимоотношения родов Triticum L. и Aegilops L. и нуклеотидные последовательности промоторных областей рДНК их отдельных представителей // Генетика. 2003. Т. 39. №1. С. 5-17. DOI:10.1023/A:1022095224123 @@Vakhitov V.A., Chemeris A.V., Sabirzhanov B.E., Akhunov E.D., Kulikov A.M., Nikonorov Yu.M., Gimalov F.R., Bikbulatova S.M., Baymiev Al.Kh. The phylogeny of Triticum L. and Aegilops L. inferred from comparative analysis of nucleotide sequences in rDNA promoter regions. Russian Journal of Genetics. 2003. V. 39. No. 1. P. 1-11. DOI:10.1023/A:1022095224123
  13. Грушецкая З.Е., Никитинская Т.В., Кубрак С.В., Дзюбан О. В., Кухарева Л.В., Поликсенова В.Д., Титок В.В., Лемеш В.А., Парфенов В.И., Хотылева Л.В. Использование ISSR-анализа для изучения внутри- и межвидового генетического полиморфизма различных таксонов высших растений // Вестник БГУ. 2013. №3. С. 50-56. @@ Grushetskaya Z.E., Nikitinskaya T.V., Kubrak S.V., Dzyuban O.V., Kukhareva L.V., Poliksenova V.D., Titok V.V., Lemesh V.A., Parfenov V.I., Khotyleva L.V. Using ISSR-analysis to study intra- and interspecific genetic polymorphism of various taxa of higher plants. Bulletin of BSU. 2013. No. 3. P. 50-56.
  14. Гуи Ф.Р., Ван Ф.Х., Гуо Я.И. Определение генетической структуры популяции инвазивного сорного растения Ageratina adenophora с помощью ISSR-PCR маркеров // Физиология растений. 2009. Т. 56. № 3. С. 453-459. DOI:10.1134/S1021443709030157 @@ Gui F.R., Wan F.H., Guo J.Y. Determination of the population genetic structure of the invasive weed Ageratina adenophora using ISSR-PCR markers. Russ J Plant Physiol. 2009. V. 56. P. 410-416. DOI:10.1134/S1021443709030157
  15. Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С. Оптимизация выделения ДНК заразихи (Orobanche cumana Wallr.) и выявление полиморфных RAPD- и SSR-локусов для генотипирования паразита масличных культур. Научно-технический бюллетень Всероссийского научно-исследовательского института масличных культур. Краснодар. 2013. №2. С. 17. @@ Guchetl S.Z., Chelyustnikova T.A., Antonova T.S. Optimization of broomrape DNA extraction (Orobanche cumana Wallr.) and identification of polymorphic RAPD and SSR loci for genotyping the oilseed parasite. Scientific and technical bulletin of the All-Russian Scientific Research Institute of Oilseeds. Krasnodar. 2013. No. 2. P. 17.
  16. Девятова Н.М., Бельтюкова Н.Н., Назаров А.В. Анализ генетического разнообразия Pоa pratensis L. в условиях нефтяного загрязнения почв с использованием IRAP-маркеров // Аграрный вестник Урала. 2011. № 1. Екатеринбург. С. 18-20. @@ Devyatova N.M., Beltyukova N.N., Nazarov A.V. Analysis of the genetic diversity of Poa pratensis L. under conditions of oil pollution of soils using IRAP markers. Agrarian Bulletin of the Urals. 2011. No. 1. P. 18-20.
  17. Дымшакова О.С., Семериков В. Л., Ласко М. Применение AFLP анализа для оценки генетического вклада родителей в потомство при гибридизации Saxifraga sibirica L. и S. cernual. // Экология. 2012. № 5. С. 319-323. DOI:10.1134/S1067413612050062 @@ Dymshakova O.S., Semerikov V.L., Lascoux M. AFLP analysis to estimate the genetic contribution of parents to progeny from hybridization between Saxifraga sibirica L. and S. cernua L. Russian Journal of Ecology. 2012. V. 43. No. 5. P. 347-351. DOI:10.1134/S1067413612050062
  18. Евдокимов И.Ю. Молекулярная филогения семейства Ranunculaceae на основе rbcL и trnL-F последовательностей хлоропластной ДНК // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии. 2017. №16. С. 240-245. @@ Evdokimov I.Yu. Molecular phylogeny of the Ranunculaceae family based on rbcL and trnL-F chloroplast DNA sequences. Problems of botany of Southern Siberia and Mongolia. 2017. No. 16. P. 240-245.
  19. Еруулт Ч., Наранхажид М., Чойжамц Г., Пурэвдорж И. Молекулярно-генетическое исследование Dasiphora fruticosa растущего в Монголии // Сибирский медицинский журнал (Иркутск). 2013. Т. 119. № 4. С. 106-110. @@ Eruult Ch., Naranhazhid M., Choizhamts G., Purevdorzh I. Molecular genetic study of Dasiphora fruticosa growing in Mongolia. Siberian Medical Journal (Irkutsk). 2013. V. 119. No. 4. P. 106-110.
  20. Зарецкая М.В., Федоренко О.М. Генетическое разнообразие и популяционная структура вида Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. острова Валаам // Труды карельского научного центра российской академии наук. 2016. №11 С. 9-16. @@ Zaretskaya M.V., Fedorenko O.M. Genetic diversity and population structure of the species Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. on Valaam island. Transactions of Karelian Research Centre of the Russian Academy of Sciences. 2016. No. 11 P. 9-16.
  21. Калаев В.Н., Землянухина О.А., Карпеченко И.Ю., Карпеченко К.А., Кондратьева А.М., Вепринцев В.Н., Карпеченко Н.А., Карпова С.С., Моисеева Е.В., Баранова Т.В. Использование методов молекулярно-генетического анализа для изучения полиморфизма ДНК растений рода Rhododendron с целью их паспортизации / фундаментальные исследования. Издательский дом "Академия естествознания". Пенза. 2012. №6 С. 323-328. @@ Kalaev V.N., Zemlyanukhina O.A., Karpechenko I.Yu., Karpechenko KA, Kondratieva A.M., Veprintsev V.N., Karpechenko N.A., Karpova S.S., Moiseeva E.V., Baranova T.V. Using the methods of molecular genetic analysis to study the DNA polymorphism of plants of the genus Rhododendron for the purpose of their certification. Basic research. Publishing House "Academy of Natural Sciences." Penza. 2012. No. 6. P. 323-328.
  22. Календарь Р.Н., Глазко В.И. Типы молекулярно-генетических маркеров и их применение // Физиология и биохимия культурных растений. 2002. Т. 34. С. 279-296. @@ Kalendar R.N., Glazko V.I. Types of molecular-genetic markers and their application. Physiology and Biochemistry of Cultivated Plants. 2002. V. 34. P. 279-296.
  23. Калько Г.В. ДНК-маркеры для оценки генетических ресурсов ели и сосны // Труды Санкт-Петербургского научно-исследовательского института лесного хозяйства. 2015. №4. С. 19-34. @@ Kalko G.V. The DNA markers for exploring of genetic resources of spruce and pine. Proceedings of the Saint Petersburg Forestry Research Institute. 2015. No. 4. P. 19-34.
  24. Калько Г.В. Тестирование ядерных микросателлитных маркеров сосны обыкновенной // Труды Санкт-Петербургского научно-исследовательского института лесного хозяйства. 2017. № 1. С. 23-34. @@ Kalko G.V. The testing of nuclear microsatellite markers of Scots pine. Proceedings of the Saint Petersburg Forestry Research Institute. 2017. No. 1. P. 23-34.
  25. Кочиева Е.З., Оганисян А.Г. Молекулярный анализ RAPD-маркеров генома картофеля // Сельскохозяйственная биотехнология. Избранные работы. Под. ред. Шевелухи В. С. Евразия. 2000. Т. 1. С. 24-32. @@ Kochieva E.Z., Oganisyan A.G. Molecular analysis of RAPD markers of the potato genome. Agricultural biotechnology. Selected works. Under. Ed. Shevelukha V.S. Eurasia. 2000. T. 1. P. 24-32.
  26. Кулуев Б.Р., Артюхин А.Е., Шевченко А.М., Михайлова Е.В. Водяной орех плавающий Trapa L.: биология, ареал распространения и исследование его изолированных популяций в озерах Нуримановского района Республики Башкортостан // Биомика. 2017. Т. 9. №2. С. 101-118. @@ Kuluev B.R., Artyukhin A.E., Shevchenko A.M., Mikhaylova E.V. 2017. Water caltrop Trapa L.: biology, habitat and the study of Its isolated populations in the lakes of Nurimanovsky district in the Republic of Bashkortostan. Biomics. 2017. V. 9. No. 2. P. 101-118.
  27. Кулуев Б.Р., Фатерыга А.В., Кулуев А.Р., Михайлова Е.В., Чемерис А.В. Молекулярно-генетическое исследование одуванчика осеннего (Taraxacum hybernum Steven) с использованием SSR-, RAPD- и ISSR-маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2018a. Т. 22. С. 102-107. DOI10.18699/VJ18.337 @@ Kuluev B.R., Fateryga A.V., Kuluev A.R., Mikhaylova E.V., Chemeris A.V. The molecular genetic study of krim-saghyz (Taraxacum hybernum Steven) using SSR, RAPD and ISSR markers. Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2018a. V. 22. P. 102-107. DOI10.18699/VJ18.337
  28. Кулуев Б.Р., Баймиев Ан.Х., Геращенков Г.А., Чемерис Д.А., Зубов В.В., Кулуев А.Р., Баймиев Ал.Х., Чемерис А.В. Методы ПЦР для выявления мультилокусного полиморфизма ДНК у эукариот, основанные на случайном праймировании // Генетика. 2018b. Т. 54. № 5. С. 495-511. DOI:10.1134/S102279541805006X @@ Kuluev B.R., Baymiev An.Kh., Gerashchenkov G.A., Chemeris D.A., Zubov V.V., Kuluev A.R., Baymiev Al.Kh., Chemeris A.V. Random priming PCR strategies for identification of multilocus DNA polymorphism in eukaryotes. Russian Journal of Genetics. 2018b. V. 54. No. 5. P. 499-513. DOI:10.1134/S102279541805006X
  29. Кулуев А.Р., Матниязов Р.Т., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В. Молекулярно-генетическое исследование Triticum sinskajae A. Filat. et Kurk. с помощью RAPD-анализа и путем сравнения нуклеотидных последовательностей вариабельного межгенного участка petN-trnC-GCA хлоропластного генома и интрона гена гистона H3.2 // Экологическая генетика. 2018c. Т. 16. №1. С. 53-59. DOI:10.17816/ecogen16153-59 @@ Kuluev A.R., Matnijazov R.T., Kuluev B.R., Chemeris A.V. A molecular genetic research of the Triticum sinskajae A. Filat. et Kurk. by RAPD analysis and by comparing the nucleotide sequences of the variable intergenic region of the petN-trnC-GCA chloroplast genome and intron of the histone H3.2 gene. Ecological Genetics. 2018c. V. 16. P. 53-59. DOI:10.17816/ecogen16153-59
  30. Кулуев Б.Р., Швец Д.Ю., Голованов Я.М., Пробатова Н.С. Тладианта сомнительная (Thladiantha dubia, Cucurbitaceae) в Башкортостане - опасный сорняк с высоким инвазионным потенциалом // Российский журнал биологических инвазий. 2018d. №4. В печати. @@ Kuluev B.R., Shvets D.Yu., Golovanov Ya.M., Probatova N.S. Thladiantha dubia (Cucurbitaceae) in Republic of Bashkortostan - a dangerous weed with high invasive potential. Russian Journal of Biological Invasions. 2018d. No. 4. In press.
  31. Костюкова E.E., Заякин В.В., Нам И.Я. Молекулярно-генетический анализ редких видов орхидных Брянской области // Бюллетень Брянского отделения РБО. 2013. № 1. С. 51-55. @@ Kostyukova E.E., Zayakin VV, Nam I.Ya. Molecular genetic analysis of rare orchid species of the Bryansk region. Bulletin of the Bryansk branch of the RBO. 2013. No. 1. P. 51-55.
  32. Логачева М.Д., Пенин А.А., Самигуллин Т.Х., Вальехо-Роман К.М., Антонов А.С. Филогения цветковых растений по последовательностям хлоропластного генома: в поисках "счастливого гена" // Биохимия. 2007. Т. 72. Вып. 12. С. 1624-1631. DOI:10.1134/S0006297907120061 @@ Logacheva M.D., Penin A.A., Samigullin T.H., Vallejo-Roman C.M., Antonov A.S. Phylogeny of flowering plants by the chloroplast genome sequences: In search of a "lucky gene". Biochemistry (Moscow). 2007. V. 72. No. 12. P. 1324-1330. DOI:10.1134/S0006297907120061
  33. Лужанин В.Г., Родионов А.В., Яковлев Г.П. Молекулярно-филогенетическое исследование рода Ononis L. (Fabaceae) во флоре России и сопредельных государств // Ботанический журнал. 2013. Т. 98. № 5. С. 629-637. @@ Luzhanin V.G., Rodionov A.V., Yakovlev G.P. Molecular-phylogenetic study of the genus Ononis L. (Fabaceae) in the flora of Russia and adjacent countries. Botanicheskii Zhurnal. 2013. V. 98. No. 5. P. 629-637.
  34. Матвеева Т. В. , Павлова О.А., Богомаз Д. И., Демкович А. Е., Лутова Л. А. Молекулярные маркеры для видоидентификации и филогенетики растений // Экологическая генетика. 2011. Т. 9. № 1. С. 32-43. @@ Matveeva T. V., Pavlova O. A., Bogomaz D. I., Lutova L. A., Demkovich A. E. Molecular markers for plant species identification and phylogenetics. Ecological Genetics. 2011. V. 9. No. 1. P. 32-43.
  35. Мельникова Н.В., Cперанская А.С., Дaрий М.В., Бeленикин М., Дмитриeв А.А., Кудрявцева А.В. Использование молекулярных маркеров, основанных на ретротранспозонах, для изучения генетического разнообразия растений // Вестник Российского государственного аграрного заочного университета. 2003. No. 14. С. 32-35. Melnikova N.V., Spranskaya A.S., Dariy M.V., Belenikin M., Dmitriev A.A., Kudryavtseva A.V. The use of molecular markers based on retrotransposons for studying the genetic diversity of plants. Bulletin of the Russian State Agrarian Correspondence University. 2003. No. 14. P. 32-35.
  36. Нечаева Ю.С., Боронникова С.В., Видякин А.И., Пришнивская Я.В., Юсупов Р.Р. Молекулярно-генетический анализ популяций хвойных видов растений на Урале и востоке европейской части России для сохранения и возобновления лесных ресурсов // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2014. Т. 16. № 1-3. С. 878-882. @@ Nechaeva Yu.S., Boronnikova S.V., Vidyakin A.I., Prishnivskaya Ya.V., Yusupov R.R. Molecular genetic analysis of populations of coniferous plants in the Urals and the east of the European part of Russia for the conservation and renewal of forest resources. Proceedings of the Samara Scientific Center of the Russian Academy of Sciences. 2014. V. 16. No. 1-3. P. 878-882.
  37. Никулин В.Ю., Гончаров А.А. Молекулярно-филогенетическая характеристика Sedum (Crassulaceae) и близких ему родов на основании сравнения нуклеотидных последовательностей гена matK хлоропластной ДНК и ITS региона рибосомной ДНК // Ботанический журнал. 2017. Т. 102. № 3. С. 309-328. @@ Nikulin V. Yu., Gontcharov A.A. Molecular-phylogenetic characterization of Sedum (Crassulaceae) and closely related genera based on cpDNA gene matK and ITS rDNA sequence comparisons. Botanicheskii Zhurnal. 2017. V. 102. No. 3. P. 309-328.
  38. Новикова А.А., Шейкина О.В., Новиков П.С., Доронина Г.У. Оценка возможности применения ISSR-маркеров для систематизации и генетической паспортизации растений рода Rhododendron // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. 2012. № 82. С. 79-89. @@ Novikova A.A., Sheykina O.V., Novikov P.S., Doronina G.U. Evaluation of the possibility of using ISSR-markers for the systematization and genetic certification of plants of the genus Rhododendron. Polythematic network electronic scientific journal of the Kuban State Agrarian University. 2012. No. 82. P. 79-89.
  39. Пришнивская Я.В., Нечаева Ю.С., Красильников В.П., Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ четырех популяций Pinus silvestris L. на востоке русской равнины на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Вестник Оренбургского государственного университета. 2016. № 2. С. 88-93. @@ Prishnivskaya Ya.V., Nechayeva Yu.S., Krasilnikov VP, Boronnikova S.V. Molecular genetic analysis of four populations of Pinus silvestris L. in the east of the Russian plain based on ISSR-marker polymorphism. Bulletin of the Orenburg State University. 2016. No. 2. P. 88-93.
  40. Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гнутиков А.А., Адельшин Р.В., Чепинога В.В. Использование генетических маркеров для оценки состояния реликтовых видов растений байкальской Сибири // Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: Экология и безопасность жизнедеятельности. 2015. № 4. С. 28-36. @@ Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Gnutikov A.A., Adelshin R.V., Chepinoga V.V. The use of genetic markers to assess the state of relict plant species of the Baikal Siberia. Bulletin of Peoples' Friendship University of Russia. Series: Ecology and Life Safety. 2015. No. 4. P. 28-36.
  41. Реунова Г.Д., Кац И.Л., Музарок Т.И., Журавлёв Ю.Н. Полиморфизм RAPD, ISSR И AFLP маркеров генома женьшеня настоящего Panax ginseng C.A. Meyer (Araliaceae) // Генетика. 2010. Т. 46. № 8. С. 1057-1066. @@ Reunova G.D., Kats I.L., Muzarok T.I., Zhuravlev Y.N. Polymorphism of RAPD, ISSR and AFLP markers of the Panax ginseng C. A. Meyer (Araliaceae) genome. Russian Journal of Genetics. 2010. V. 46. No. 8. P. 938-947. DOI:10.1134/S1022795410080053
  42. Сагындыкова М.С., Иманбаева А.А., Сарсенбаев К.Н. Изучение лекарственного растения Ferula foetida с использованием RAPD-PCR анализа ДНК в природных популяциях Мангистау // В сборнике: Биологические особенности лекарственных и ароматических растений и их роль в медицине сборник научных трудов Международной научно-практической конференции, посвященной 85-летию ВИЛАР. 2016. С. 149-152. @@ Sagyndykova MS, Imanbaeva A.A., Sarsenbayev K.N. Study of the medicinal plant Ferula foetida using RAPD-PCR DNA analysis in natural populations of Mangystau. In collection: Biological features of medicinal and aromatic plants and their role in medicine collection of scientific papers of the International Scientific and Practical Conference dedicated to the 85th anniversary of VILAR. 2016. P. 149-152.
  43. Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Боронникова С.В., Нечаева Ю.С. Эколого-генетический анализ популяционной структуры Populus tremula L. в пермском крае // Экологическая генетика. 2012. Т. 10. № 3. С. 22-27. @@ Svetlakova T.N., Boboshina I.V., Boronnikova S.V., Nechaeva Yu.S. Ecological and genetic analysis of population structure of Populus tremula L. in Perm region. Ecological Genetics. 2012. V. 10. No. 3. P. 22-27.
  44. Симчук А.П., Ивашов А.В., Оберемок В.В., Гюрбюз М.Ф. Влияние генетической изменчивости дуба пушистого и зеленой дубовой листовертки на компоненты приспособленности ее паразита Brachimeria intermedia (Hymenoptera: chalcididae) // Экосистемы, их оптимизация и охрана. 2015. Вып. 6. С. 115-120. @@ Simchuk A.P., Ivashov A.V., Oberemok V.V., Gurbuz M.F. Influence of genetic variability of oak fluffy oak and green oak moth on the components of fitness of its parasite Brachimeria intermedia (Hymenoptera: chalcididae). Ecosystems, their optimization and protection. 2015. V. 6. P. 115-120.
  45. Спиридович Е.В., Фоменко Т.И., Власова А.Б., Мазур Т.В., Юхимук А.Н. Биохимический и молекулярно-генетический анализ многоколосника морщинистого (Agastache rugosa (Fisch. et Mey.) Kuntze) в культуре in vitro // Вестник фармации. 2012. № 4. С. 75-87. @@ Spiridovich E.V., Fomenko T.I., Vlasova AB, Mazur T.V., Yukhimuk A.N. Biochemical and molecular genetic analysis of Agastache rugosa (Fisch. et Mey.) Kuntze in the culture in vitro. Bulletin of pharmacy. 2012. No. 4. P. 75-87.
  46. Сулимова Г.Е. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения // Успехи современной биологии. 2011. Т. 9. С. 32-43. @@ Sulimova G.E. DNK-markers in genetic studies: types of markers, their characteristics and application. Uspekhi Sovremennoy Biologii. 2011. V. 9. P. 32-43.
  47. Сухарева А.С., Кулуев Б.Р. ДНК-маркеры для генетического анализа сортов культурных растений // Биомика. 2018. Т. 10. № 1. С. 69-84. DOI:10.31301/2221-6197.bmcs.2018-15 @@ Sukhareva A.S., Kuluev B.R. DNA markers for genetic analysis of crops. Biomics. 2018. V. 10. No. 1. P. 69-84. DOI:10.31301/2221-6197.bmcs.2018-15
  48. Тухватуллина Л.А., Абрамова Л. М. Редкие ресурсные дикорастущие луки флоры Башкортостана в условиях интродукции // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2012. №1. С. 33-35. @@ Tukhvatullina L.A., Abramova L.M. Rare resource bows wild flora of Bashkortostan in the conditions of introduction. Bulletin of the Orenburg State Agrarian University. 2012. No. 1. P. 33-35.
  49. Федоров Н.И., Редькина Н.Н., Янбаев Ю.А., Михайленко О.И. Сравнительный анализ изменчивости изоферментных локусов видов Thalictrum L. на Южном Урале // Актуальные проблемы генетики и молекулярной биологии. Материалы всероссийской молодежной конференции в рамках федеральной целевой программы "научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009-2013 годы. Министерство сельского хозяйства Российской Федерации. ФГБОУ ВПО "Башкирский государственный аграрный университет". 2012 С. 90-92. @@ Fedorov N.I., Redkina N.N., Yanbaev Yu.A., Mikhaylenko O.I. Comparative analysis of the variability of isozyme loci of Thalictrum L. species in the Southern Urals. Actual problems of genetics and molecular biology. Materials of the All-Russian Youth Conference in the framework of the federal target program "Scientific and Scientific-Pedagogical Personnel of Innovative Russia" for 2009-2013. Ministry of Agriculture of the Russian Federation. Bashkir State Agrarian University ". 2012. P. 90-92.
  50. Фролова Л.Л., Сабиров М.С., Фирсова С.С. Филогенетический анализ генов rbcL, cpcA, cpcB, psaA, atpB индикаторных фитопланктонных организмов // Георесурсы. 2012. № 6. С. 45-48. @@ Frolova L.L., Sabirov M.S., Firsova S.S. Phylogenetic analysis of rbcL, cpcA and cpcB, psaA, atpB genes of indicating phytoplankton organisms. Georesources. 2012. No. 6. P. 45-48.
  51. Хлесткина Е.К. Молекулярные маркеры в генетических исследованиях и в селекции // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17. №4/2. С. 1044-1054. @@ Khlestkina E.K. Molecular markers in genetic studies and breeding. Russian Journal of Genetics: Applied Research. 2014. Т. 4. No. 3. P. 236-244. DOI:10.1134/S2079059714030022
  52. Янбаев Р.Ю., Габитова А.А., Султанова Р.Р., Боронникова С.В., Янбаев Ю.А. ISSR-анализ полиморфизма ДНК дуба черешчатого: аргументы в пользу использования для лесовосстановления семян местных насаждений // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2017. № 1. С. 220-222. @@ Yanbaev R.Yu., Gabitova A.A., Sultanova R.R., Boronnikova S.V., Yanbaev Yu.A. ISSR analysis of DNA polymorphism of pedunculate oak: arguments in favor of using local plantations for reforestation of seeds. Proceedings of the Orenburg State Agrarian University. 2017. No. 1. P. 220-222.
  53. Arif I.A., Khan H.A., Bahkali A.H., Homaidan A.A., Farhan A.A., Sadoon, M.A., Shobrakc M. DNA marker technology for wildlife conservation // Saudi J Biol Sci. 2011 V. 18. P. 219-225. DOI:10.1016/j.sjbs.2011.03.002
  54. Awasthi A., Nagaraja G., Naik G., Kanginakudru S., Thangavelu K., Nagaraju J. Genetic diversity and relationships in mulberry (genus Morus) as revealed by RAPD and ISSR marker assays // BMC Genetics. 2004. V. 5. P. 1-9. DOI:10.1186/1471-2156-5-1
  55. Baumel A., Ainouche M., Kalendar R., Schulman A.H. Retrotransposons and genomic stability in populations of the young allopolyploid species Spartina anglica C.E. Hubbard (Poaceae) // Mol Biol Evol. 2002. V. 19. 1218-1227. DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004182
  56. Bitonti M.B., Cozza R., Wang G., Ruffini-Castiglione M., Mazzuca S., Castiglione S., Sala F., Innocenti A.M. Nuclear and genomic changes in floating and submerged buds and leaves of heterophyllous water chestnut (Trapa natans) // Physiolgia Plantarum. 1996. V. 97. P. 21-27.
  57. Bhattacharyya P., van Staden J. Molecular insights into genetic diversity and population dynamics of five medicinal Eulophia species: a threatened orchid taxa of Africa // Physiol Mol Biol Plants. 2018. V. 24. P. 631-641. DOI:10.1007/s12298-018-0523-6
  58. Blackmore T., Thomas I., McMahon R., Powell W., Hegarty M. Genetic-geographic correlation revealed across a broad European ecotypic sample of perennial ryegrass (Lolium perenne) using array-based SNP genotyping // Theor Appl Genet. 2015. V. 128. P. 1917-1932. DOI:10.1007/s00122-015-2556-3
  59. Blouin M.S., Parsons M., Lacaille V., Lotz S. Use of microsatellite loci to classify individuals by relatedness // Molecular Ecology. 1996. V. 5. P. 393-401.
  60. Dizkirici A., Kansu C., Onde S. Molecular phylogeny of Triticum and Aegilops genera based on its and MatK sequence data // Pakistan Journal of Botany. 2016. V. 48. P. 143-153.
  61. Ebadi M., Eghbali M. Study of different wheat cultivars using the ISSR marker // World Family Medicine. 2017. V. 10. P. 296-301. DOI:10.5742/MEWFM.2017.93178
  62. Flavell A.J., Knox M.R., Pearce S.R., Ellis T.H. Retrotransposon-based insertion polymorphisms (RBIP) for high throughput marker analysis // Plant J. 1998. V. 16. P. 643-650.
  63. Foster T.F., Allan G.J., Chan A.P., Rabinowicz P.D., Ravel J., Jackson P.J., KeimP. Single nucleotide polymorphisms for assessing genetic diversity in castor bean (Ricinus communis) // BMC Plant Biol. 2010. DOI:10.1186/1471-2229-10-13
  64. Gawel M., Wisniewska I., Rafalski A. Semi-specific PCR for the evaluation of diversity among cultivars of wheat and triticale // Cell Mol Biol Lett. 2002. V. 7. P. 577-582.
  65. Gilani S.A., HiranoH., Fujii Y., Watanabe K. AFLP and PBA polymorphisms in an endangered medicinal plant, Rhazya stricta, in Pakistan // Plant Genetic Resources. 2014. V. 12. P. 199-206.
  66. Golovnina K.A., Glushkov S.A., Blinov A.G., Mayorov V.I., Adkison L.R., Goncharov N.P. Molecular phylogeny of genus Triticum L. // Plant Syst Evol. 2007. V. 264. P. 195-216. DOI:10.1007/s00606-006-0478-x
  67. Grzebelus D., Stawujak K., Mitoraj J., Szklarczyk M. Dynamics of vulmar/vulmite group of transposable elements in Chenopodiaceae subfamily Betoideae // Genetica. 2011. V. 139. P. 1209-1216. DOI:10.1007/s10709-011-9622-9
  68. Gustafsson A.L., Skrede I., Rowe H.C., Gussarova G., Borgen L., Rieseberg L.H., Brochmann C., Parisod C. Genetics of cryptic speciation within an Arctic mustard, Draba nivalis // PLoS One. 2014. V. 9(4): e93834. DOI:10.1371/journal.pone.0093834
  69. He R.L., Han Y.L., Wang F., Liu J.Q., Wang L.H. Analysis on SSR information in transcriptome of Astragalus membranaceus var. mongholicus and its polymorphism // Zhongguo Zhong Yao Za Zhi. 2018. V. 43. P. 1838-1843. DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20180307.002
  70. Huang S., Sirikhachornkit A., Faris J.D., Su X., Gill B.S., Haselkorn R., Gornicki P. Phylogenetic analysis of the acetyl-CoA carboxylase and 3-phosphoglycerate kinase loci in wheat and other grasses // Plant Mol Biol. 2002. V. 48. P. 805-820. DOI:10.1023/A:1014868320552
  71. Huang Q., Wang Z., Wang T., Su Y. Development and characterization of 23 polymorphic microsatellite loci for Amentotaxus argotaenia (Taxaceae), a relict vulnerable species // Appl Plant Sci. 2018. V. 23. 6(5):e01149. DOI:10.1002/aps3.1149
  72. Ievina B., Syed N.H., Flavell A.J., Ievinsh G., Rostoks N. Development of retrotransposon-based SSAP molecular marker system for study of genetic diversity in sea holly (Eryngium maritimum L.) // Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization. 2010. V. 8. P. 258-266. DOI:10.1017/s1479262110000316
  73. Jarne P., Lagoda P.J. Microsatellites, from molecules to populations and back //-Trends in Ecology and Evolution. 1996. V. 11. P. 424-429.
  74. Ji F., Wei W., Liu Y., Wang G., Zhang Q., Xing Y., Zhang S., Liu Z., Cao Q., Qin L. Construction of a SNP-based high-density genetic map using genotyping by sequencing (GBS) and QTL analysis of nut traits in Chinese chestnut (Castanea mollissima Blume) // Front Plant Sci. 2018. V. 14. 816. DOI:10.3389/fpls.2018.00816
  75. Jing E., Gesta S., Kahn C.R. SIRT2 regulates adipocyte differentiation through FoxO1 acetylation/deacetylation // Cell Metab. 2007. V. 6. P. 105-114.
  76. Kachare S., Tiwari S., Tripathi N. Morphological and molecular assessment of genetic diversity of water chestnut (Trapa natans) from different ponds of central India // World Research Journal of Cell Biology. 2013. V. 1. P. 028-031.
  77. Kalendar R., Grob T., Regina M., Suoniemi A., Schulman A.H. IRAP and REMAP: two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques // Theor. Appl Genet. 1999. V. 98. P. 704-711.
  78. Kalendar R., Schulman A.H. IRAP and REMAP for retrotransposon-based genotyping and fingerprinting // Nature Protoc. 2006. V. 1. P. 2478-2484.
  79. Kanazin V., Blake T., Shoemaker R. Organization of the histone H3 genes in soybean, barley and wheat // Mol. Gen. Genet. 1996. V. 250. P. 137-147.
  80. Karp A., Edwards K., Bruford M., Vosman B., Morgante M., Seberg O.,Kremer A., Boursot P., Arctander P., Tautz D., Hewitt G. Newer molecular technologies for biodiversity evaluation: opportunities and challenges // Nature Biotechnol. 1997. V. 15. P. 625-628.
  81. Kuhn B.C., Mangolin C.A., Souto E.R., Vicient C.M., Machado M.F. Development of retrotransposon-based markers IRAP and REMAP for cassava (Manihot esculenta) // Genet Mol Res. 2016. V. 15. DOI:10.4238/gmr.15027149
  82. Mahatma M.K., Srivashtav V.S., Jha S. Genetic diversity analysis of date palm using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR). Methods Mol Biol. 2017. V. 1638. P. 105-112. DOI:10.1007/978-1-4939-7159-6_10
  83. Marwal A., Sahu A.K., Choudhary D.K., Gaur R.K. Complete nucleotide sequence of a begomovirus associated with satellites molecules infecting a new host tagetes patula in India // Virus Genes. 2014. V. 47. P. 194-198. DOI:10.1007/s11262-013-0914-2
  84. Matveeva T.V., Simonova A.V., Lutova L.A. Molecular markers of inbred radish (Raphanus sativus var. Radicola pers) lines // Cell and Mol. Biol. Lett. 2002. V. 7. P. 845-848.
  85. McAssey E.V., Gudger E.G., Zuellig M.P., Burke J.M. Population genetics of the rubber-producing Russian dandelion (Taraxacum kok-saghyz) // PLoS One. 2016. V. 11. DOI10.1371/journal.pone.0146417
  86. Ming-na L., Rui-cai L., Zi-rong F., Feng-qi L., Yan S., Kun Z., Jun-mei K., Zhen W., Shi-hao C. Transcriptome analysis of salt-responsive genes and SSR marker exploration in Carex rigescens using RNA-seq // Journal of Integrative Agriculture. 2018. V. 17. P. 184-196.
  87. Mukrimin M., Kovalchuk A., Neves L.G., Jaber E.H.A., Haapanen M., Kirst M., Asiegbu F.O. Genome-wide exon-capture approach identifies genetic variants of Norway spruce genes associated with susceptibility to Heterobasidion parviporum infection // Front Plant Sci. 2018. V. 9: 793. DOI:10.3389/fpls.2018.00793
  88. Li S.F, Wang L.J, Deng C.L, Gao W.J. Identification of male-specific AFLP and SCAR markers in the dioecious plant Humulus scandens // Mol Cell Probes. 2017. V. 34. P. 68-70. DOI:10.1016/j.mcP.2017.05.007
  89. Li W., Gao Z., Xiao W., Wei Y., Liu Y., Chen G., Pu Z., Chen H., Zheng Y. Molecular diversity of restriction enzyme sites, indels and upstream open reading frames (uORFs) of 5' untransalted regions (UTRs) of Waxy genes in Triticum L. and Aegilops L. species // Genetic Resources and Crop Evolution. 2012. V. 59. P. 1625-1647.
  90. Li X.L., Fan X.R., Chu H.J., Wei Li., Chen Y.Y. Genetic delimitation and population structure of three Trapa taxa from the Yangtze River, China // Aquatic Botany. 2017. V. 136. P. 61-70.
  91. Li-Na G., Xue-Li Z., Xin-Fen G. De novo assembly and characterization of leaf transcriptome for the development of EST-SSR markers of the non-model species Indigofera szechuensis // Biochemical Systematics and Ecology. 2016. V. 68. P. 36-43.
  92. Liu X., Zhang X., Shi Y., Tang D. Genetic diversity analysis of nine narcissus based on morphological characteristics and random amplified polymorphic DNA markers // Hortscience. 2017. V. 52, No. 2. P. 212-220. DOI:10.21273/HORTSCI11171-16
  93. Nadot S., Bajon R., Lejeune B. The chloroplast gene rps4 as a tool for the study of Poaceae phylogeny // Plant Syst. Evol. 1994. V. 191. P. 27-38.
  94. Nagy E.D., Molnar I., Schneider A., Kovacs G., Molnar-Lang M. Characterization of chromosome-specific S-SAP markers and their use in studying genetic diversity in Aegilops species // Genome. 2006. V. 49. P. 289-296.
  95. Nguyen T.X., Lee S.I., Rai R., Kim N.S., Kim J.H. Ribosomal DNA locus variation and REMAP analysis of the diploid and triploid complexes of Lilium lancifolium // Genome. 2016. V. 59. P. 551-564. DOI:10.1139/gen-2016-0011
  96. Nimbal S., Behl R.K., Chhabra A.K. RAPD analysis for genetic polymorphism in bread wheat (Triticum aestivum L.) genotypes varying for grain protein content // The South Pacifi c J. Nat. Sci. 2009. V. 27. P. 49-56. DOI:10.1071/SP09009
  97. Olmstead R.G., Sweere J.A. Combining data in phylogenetic systematics: An empirical approach using three molecular data sets in the Solanaceae // Syst. Biol. V. 43. P. 467-481.
  98. Ouyang P., Kang D., Mo X., Tian E., Hu Y., Huang R. Development and characterization of high-throughput EST-based SSR markers for Pogostemon cablin using transcriptome sequencing // Molecules. 2018. V. 23. pii: E2014. DOI:10.3390/molecules23082014
  99. Pakhrou O., Medraoui L., Yatrib C., Alami M., Filali-Maltouf A., Belkadi B. Assessment of genetic diversity and population structure of an endemic Moroccan tree (Argania spinosa L.) based in IRAP and ISSR markers and implications for conservation // Physiol Mol Biol Plants. 2017. V. 23. P. 651-661. DOI:10.1007/s12298-017-0446-7
  100. Palombi M.A., Damiano C. Comparison between RAPD and SSR molecular markers in detecting genetic variation in kiwifruit (Actinidia deliciosa A. Chev) // Plant Cell Reports. 2002. V. 20. P. 1061-1066.
  101. Pandotra P., Gupta A., Khan S., Ram G., Gupta S. A comparative assessment of ISSR, RAPD, IRAP, and REMAP molecular markers in Zingiber officinale germplasm characterization // Scientia Horticulturae. 2015. V. 194. P. 201-207.
  102. Paux E., Faure S., Choulet F., Roger D., Gauthier V., Martinant J., Sourdille P., Balfourier F., Le Paslier M., Chauveau A., Cakir M., Gandon B., Feuillet C. Insertion site-based polymorphism markers open new perspectives for genome saturation and marker-assisted selection in wheat // Plant Biotechnol. 2010. V. 8. P. 196-210. DOI:10.1111/j.1467-7652.2009.00477.x
  103. Polanco C., Ruiz M. AFLP analysis of somaclonal variationin Arabidopsis thaliana regenerated plants // Plant Sci. 2002. V. 162. P. 817-824.
  104. Prince L.M. Plastid primers for angiosperm phylogenetics and phylogeography // Appl Plant Sci. 2015. V. 3. pii: apps.1400085. DOI:10.3732/apps.1400085
  105. Prazak R. Paczos-Grzeda E. Genetic similarity among Aegilops kotschyi Boiss. with Triticum aestivum L. hybrid lines // Romanian Agricultural Research. 2017. V. 34. P. 15-23.
  106. Queller D.C., Strassmann J.E., Hughes C.R. Microsatellites and kinship // Trends in Ecology and Evolution. 1993. V. 8. P. 285-288.
  107. Rani V., Parida A., Raina S.N. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers for genetic analysis in micropropagated plants of Populus deltoides Marsh. // Plant Cell Rep. 1995. V.14. P.459-462. DOI:10.1007/bf00234055.
  108. Reddy, R.P., Sarla, N., Siddiq, E.A. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding // Euphytica. 2000. V. 128. P. 9-17.
  109. Rohlf F.J. NTSYSpc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version 5.1. Exeter Publishing Ltd., Setauket, N.Y.2001.
  110. Romero G., Adeva C., Battad Z. Genetic fingerprinting: advancing the frontiers of crop biology research // Phil Sci Let. 2009. V. 2. P. 8-13.
  111. Ronikier M. The use of AFLP markers in conservation genetics--a case study on pulsatilla vernalis in the polish lowlands // Cell Mol Boil Lett. 2002 V. 7. P. 677-684.
  112. Roy N.S., Lee S.I., Nkongolo K., Kim N.S. Retrotransposons in Betula nana, and interspecific relationships in the Betuloideae, based on inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) markers // Genes Genomics. 2018. V. 40. P. 511-519. DOI:10.1007/s13258-018-0655-7
  113. Savelkoul P.H, Aarts H.J., De Haas J., Dijkshoorn L., Duim B., Otsen M., Rademaker J.l., Schouls L., Lenstra J.A. Amplified-Fragment Length Polymorphism analysis: the state of an art // J Clin Microbiol. 1999. V. 37. P. 3083-3091.
  114. Senerchia N., Felber F., Parisod C. Contrasting evolutionary trajectories of multiple retrotransposons following independent allopolyploidy in wild wheats // New Phytol. 2014. V. 202. P. 975-985. DOI:10.1111/nph.12731
  115. Sobrino B., Briоn M., Carracedo A. SNPsin forensic genetics: a review on SNP typing methodologies // Forensic Sci Int. 2005. V. 154. P. 181-194.
  116. Sorkheh K., Amirbakhtiar N., Ercisli S. Potential start codon targeted (SCoT) and Inter-retrotransposon Amplified Polymorphism (IRAP) markers for evaluation of genetic diversity and conservation of wild Pistacia species population // Biochem Genet. 2016. V. 54. P. 368-387. DOI:10.1007/s10528-016-9725-1
  117. Sorkheh K., Dehkordi M.K., Ercisli S., Hegedus A., Halasz J. Comparison of traditional and new generation DNA markers declares high genetic diversity and differentiated population structure of wild almond species // Sci Rep. 2017. V. 7. P. 5966. DOI:10.1038/s41598-017-06084-4
  118. Taberlet P., Gielly L., Pautou G., Bouvet J. Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA // Plant Mol Biol. 1991. V. 17. P. 1105-1109.
  119. Tang S., Dai W., Li M., Zhang Y., Geng Y., Wang L., Zhong Y. Genetic diversity of relictual and endangered plant Abies ziyuanensis (Pinaceae) revealed by AFLP and SSR markers // Genetica. 2007. V. 133. P. 21-30.
  120. Tsuchihashi Z., Dracopoli N. Progress in high throughput SNP genotyping methods // Pharmacogenomics. 2002. V. 2. P. 103-110.
  121. Van de Peer Y. Treecon for Windows: a software package for the construction and drawing evolutionary trees for the Microsoft Windows environment // Computer Application in the Biosciences. 1994. V.10. No. 5. P. 569-570.
  122. Vos P.R., Hogers M., Bleeker M. T Van De Lee, Hornes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Kuiper M. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting // Nucl. Acids Res. 1995. V. 23. P. 4407-4414.
  123. Waugh R., Mclean K., Flavell J., Pearce S.R., Kumar A., Thomas B., Powell W. Genetic distribution of bare-1-like retrotransposable elements in the barley genome revealed by Sequence-Specific Amplification Polymorphisms (S-SAP) // Mol. Gen. Genet. 1997. V. 253. P. 687-694.
  124. Williams J.G., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucleic Acids Res. 1990. V. 8. P. 6531-6535.
  125. Yang M., Han N., Li H., Meng L. Transcriptome analysis and microsatellite markers development of a traditional Chinese medicinal herb Halenia elliptica D. Don (Gentianaceae) // Evol Bioinform Online. 2018. V. 14. DOI:10.1177/1176934318790263
  126. Zabeau M., Vos P. Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting. European patent application 92402629.7 (publ. n. 0 534 858 a1). 1993.
  127. Zawko G., Krauss S., Dixon K.W., Sivasithamparam K. Conservation genetics of the rare and endangered Leucopogon obtectus (Ericaceae) // Mol. Ecol. 2001 V. 10. P. 2389-2396.
  128. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple-sequence repeat (SSR) - anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. V. 20. P. 176-183.
Скачать pdf
наверх
eISSN: 2221-6197 DOI: 10.31301/2221-6197