Секвенирование полного генома алкало- и галотолерантного штамма нитритофильной бактерии Halomonas Sp. G4.
Год: 2012
Страницы: 29-30
Номер: Том 4, № 1
Тип: научная статья
Рубрика: Том 4, № 1
Авторы: Матниязов Рустам Тахирович, Ахунов Эдуард Диргатович, Малеев Григорий Владимирович, Гильванова Елена Альбертовна, Усанов Николай Глебович, Усанов Николай Николаевич, Щелчкова Е.А.!, Бикбулатова Светлана Магнитовна, Чемерис Алексей Викторович, Чемерис Дмитрий Алексеевич, Никоноров Юрий Михайлович
Аннотация:
Осуществлено секвенирование генома бактерии Halomonas штамма G4, выделенного из придонных осадков содового озера в Бурятии. Проведены его параметрический анализ и сравнение с типовым штаммом H. elongata
Ключевые слова:
полногеномное секвенирование, Halomonas
Библиографический список:
1. Schwibbert K., Marin-Sanguino A., Bagyan I., Hei-drich G., Lentzen G., Seitz H., Rampp M., Schuster S.C., Klenk H.P., Pfeiffer F., Oesterhelt D., Kunte H.J. A blueprint of ectoine metabolism from the genome of the industrial producer Halomonas elongata DSM 2581T // Environ. Microbiol. 2010. V.13. P.1973-1994.
2. Copeland A., O’Connor K., Lucas S., Lapidus A., Berry K.W., Detter J.C., Glavina Del Rio T., Hammon N., Dalin E., Tice H., Pitluck S., Bruce D., Goodwin L., Han C., Tapia R., Saunders E., Schmutz J., Brettin T., Larimer F., Land M., Hauser L., Vargas C., Nieto J.J., Kyrpides N.C., Ivanova N., Göker M., Klenk H-P., Csonka L.N., Woyke T. Complete genome sequence of the halophilic and highly halotolerant Chromohalobacter salexigens type strain (1H11T ) // Stand Genomic Sci. 2011. V.5. P.379–388.
3. Kawata Y., Kawasaki K., Shigeri Y. Draft genome sequence of Halomonas sp. strain KM-1, a moderately halophilic bacterium that produces the bioplastic poly(3-hydroxybutyrate) // J. Bacteriol. 2012. V.194. P.2738–2739.
4. Phung L.T., Silver S., Trimble W.L., Gilbert J.A. Draft genome of Halomonas species strain GFAJ-1 (ATCC BAA-2256) // J. Bacteriol. 2012. V.194. P.1835–1836.
5. Lin Y., Fan H., Hao X., Johnstone L., Hu Y., Wei G., Alwathnani H.A., Wang G., Rensing C. Draft genome sequence of Halomonas sp. strain HAL1, a moderately halophilic arseniteoxidizing bacterium isolated from gold-mine soil. J. Bacteriol. 2012. V.194. P.199–200.