Biomics

Рассмотрены некоторые особенности устройства и функционирования ДНК-термоциклеров, работающих в режиме реального времени. Представленный список моделей данных приборов, производимых многочисленными фирмами, свидетельствует о широком разнообразии подобных ДНК-термоциклеров, способных удовлетворить различные запросы исследователей, как по техническим параметрам, так и по цене. Кратко описаны способы регистрации результатов при проведении ПЦР в реальном времени. Более подробно рассмотрена весьма перспективная технология цифровой ПЦР, приборное оснащение для которой пока представлено фактически единичными моделями. Высказано предположение, что подобная техника будет быстро совершенствоваться и становиться все более популярной вплоть до того, что заменит в некоторых случаях нынешнюю ПЦР в реальном времени.

ПЦР, ПЦР в реальном времени, количественная ПЦР, цифровая ПЦР, ДНК-термоциклер, ДНК-термоциклер с оптическим модулем, ДНК-амплификатор

1. Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю., Семенов П.А., Савилова А.М., Кофиади И.А., Абрамов Д.Д. ПЦР в реальном времени / М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009. 223 С.
2. Чемерис А.В., Никоноров Ю.М., Чемерис Д.А., Гарафутдинов Р.Р., Романенкова М.Л., Матниязов Р.Т., Гималов Ф.Р., Малеев Г.В., Вахитов В.А. ПЦР, ЛЦР и ГЦР - цепные реакции нуклеиновых кислот в режиме реального времени // Вестн. биотехнол. физ.-хим. биол. 2005. Т. 1, №2. С. 5-14.
3. Bhat S., Herrmann J., Armishaw P., Corbisier P., Emslie K.R. Single molecule detection in nanofluidic digital array enables accurate measurenent of DANN copy number // Anal. Bioanal. Chem. 2009. V.394. P.457-467.
4. Chemeris A.V., Nikonorov Yu.M., Romanenkova M.L., Chemeris D.A., Garafutdinov R.R., Magazova R.A., Maleev G.V., Vakhitov V.A., Vasilov R.G. Novel methods of amplifying DNA or RNA with real-time PCR // United States Patent Application Publication No 2007/0117125 A1, May, 24 2007.
5. Forster T. Energiewanderung und fluoreszenz // Naturwissenschaften. 1946. V. 33. P. 166-175.
6. Higuchi R., Dollinger G., Walsh P.S., Griffith R. Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences // Biotechnology. 1992. V. 10. P.413-417.
7. Higuchi R., Fockler C., Dollinger G., Watson R. Kinetic PCR analysis: realtime monitoring of DNA amplification reactions // Biotechnology. 1993. V. 11. P.1026-1030.
8. Holland P.M., Abramson R.D., Watson R., Gelfand D.H. Detection of specific polymerase chain reaction product by utilizing the 5'3' exonuclease activity of Thermus aquaticus DNA polymerase // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V. 88. P. 7276-7280.
9. Lee L.G., Connell C.R., Bloch W. Allelic discrimination by nick-translation PCR with fluorogenic probes // Nucl. Acids Res. 1993. V. 21. P. 3761-3766.
10. McCaughan F., Dear P.H. Single-molecules genomics // J.Pathol. 2010. V.220. P.297-306.
11. Mullis K.B., Faloona F.A. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction // Meth. Enzymol. 1987. V.155. P.335-350.
12. Saiki R.K., Scharf S., Faloona F., Mullis K.B., Horn G.T., Erlich H.A., Arnheim N. Enzymatic amplification of b-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sicle cell anemia // Science. 1985. V. 230. P. 1350-1354.
13. Vogelstein B., Kinzler K.W. Digital PCR // Proc. Natl. Acad.Sci. USA. 1999. V. 96. P. 9236-9241.
14. Weaver S., Dube S., Mir A., Qin J., Sun G., Ramakrishnan R., Jones R.C., Livak K.J. Taking qPCR to a higher level: Analysis of CNV reveals the power of high throughput qPCR to enhance quantitative resolution // Methods. 2010. V.50. P.271-276.
15. Yourno J. A method for nested PCR with single closed reaction tubes // PCR Methods Appl. 1992. V. 2. P.60-65.
16. Zhang C., Xing D. Single-molecules DNA amplification and analysis using microfluidics //Chem/ Rev. 2010. V.110. P.4910-4947.